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化学计算药物设计综合软件-康昱盛.PDF
化学计算 / 药物设计综合软件 分子建模和模拟/ 蛋白质建模和生物信息学/ 基于结构的药物设计/ 化学信息学和高通量筛选/ 药效团建模/ 数据库与开发环境/ URL: 制药及生命科学研究提供最佳分子设计环境 MOE （Molecular Operating Environment ）分子操作环境，是由加拿大化学计算集团 公司Chemical Computing Group Inc.开发的针对制药和生命科学的综合软件系统。它是 一个综合的应用环境和技术开发平台，集可视化、模拟和应用开发于一体。 MOE 在统一的操作环境下能通过分子模拟、蛋白质结构分析、小分子数据处理以及蛋白质 与小分子对接研究等应用工具全方位支持药物设计。 分子建模和模拟 蛋白建模和生物信息学 图形用户界面 MOE的图形用户界面（GUI）为各种运行平台（从PC到工作站）的用户提供统一的工作环境。菜单和控制面板可根据用户需 基于结构的药物设计 要定制，用户工作环境也可随意设置。主窗口包括了小分子、氨基酸片段库、核酸和糖类的构建器以及SMILES格式的输入 界面。MOE提供多种显示功能，如分子表面形状、蛋白质二级结构和氢键等等。MOE同样支持硬件三维视图。 化学信息学和高通量筛选 分子数据库管理 数据库有一种基本格式，MDB (Molecular Database)，可以高效地处理计算化学中的大量数据，并且能让用户以Excel表格 药效团建模 形式快速访问。它可以保存分子动力学、构象有哪些信誉好的足球投注网站、库设计、QSAR等结果，然后用统计和图表的方式分析。 开发环境 数据库与开发环境 MOE中大部分应用程序均是用SVL语言编写，并且源代码是公开的。使用SVL文本编辑器，用户可轻易的访问程序内容并 修改算法或参数；同样，用户也可以编写其自身需要的应用功能。SVL程序和脚本可在不同的硬件上运行。 2 2016 © CloudScientific All Rights Reserved 2016 © CloudScientific All Rights Reserved 3 支持药物研究的强大且全面的功能 蛋白质建模和生物信息学 ~P8 MOE ，提供了用以解决药物设计，生命科学研究等相关问题的计算化学的全面的功能模块。比如，可以分
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