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基因工程综合大实验实验设计

基因工程综合大实验实验设计 Iso基因克隆转化大肠杆菌 摘要:将iso合成酶基因,通过puc19,T4连接酶连接到大肠杆菌上,通过AMP抗性的方法筛选出可能的目的菌落,采用PCR进行鉴定。 1目的基因的获得(PCR) 采用CTAB法制备根据已经发表的基因的5′ 端编码区序列和′ 端编码区序列分别设计下列扩增引物5′ GGCGCGCCGGATCCGAATTCCTTCGGGTTCAGACAGGAGCAG G3′(Asc/BamHⅠ/ EcoRⅠ)′ GGCGCGCCGGATCCCTCCGATCTTATCTCTATTGCTCGT 3′ (AscⅠ/BamHⅠ) 引物中存在两个到三个酶切位点 反应体系 工作浓度 PCR扩增程序 Mgcl2 2 ul 1 94℃ 变性 4min dNTPs 1 ul 2 94℃ 变性 30sec 正向引物 1 ul 3 55℃ 退火 30sec, 反向引物 1 ul 4 72℃ 延伸 30sec 至30个循环 TapDNA聚合酶 1 ul 5 72℃ 延伸 10min 模板 1ul 6 10xtaqDNA聚合酶缓冲液 2 ul ddH2O 11 UL 将PCR的扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,琼脂糖浓度为%,电压60V,电泳时间1左右切胶,将目标带从凝胶中切下来,转入1.5mL离心管中; 加入3倍胶重GS Buffer,将离心管置于50水浴中,使胶融化; 加入1/2 倍体积的PH Buffer混匀后转入离心柱,4离心,10 000rpm,30s; 弃收集管中下清液,加入500μl W2于离心柱中,10 000rpm,离心30s,弃滤液;(重复4操作步骤)将离心柱放回收集管中,最高速离心1min,以弃尽W2; 小心取出离心柱,将其套入一个无菌的1.5ml ep管中,在吸附膜中央加入50μl EB,室温静置2-10min后,最高速离心1min洗脱DNA片段; 取出离心柱,将1.5ml ep管(DNA溶液)置于-20保存备用。solution I : 50mM 葡萄糖 25mM Tris.Cl(PH8.0)10mM EDTA (PH8.0) solution II: 0.2M NaOH 1% SDS 使用前现配现用 solution III (100ml): 5M KAc 60.0m1 冰醋酸 11.5m1 蒸馏水 28.5ml 10mg/mlRNase:称取 100mg Rnase,溶于10ml 10mM Tris.Cl(pH7.5),15 mM NaCl中,加热煮沸15分钟,冷却后分装成小份,-20冻存。 TE buffer(pH8.0):10mM Tris.Cl (pH8.0) 1mM EDTA (pH8.0) (2)提取程序 挑取含目的基因的大肠杆菌单菌落,接种于5ml带有相应抗生素的LB液体培养基中,在37℃,250rpm条件下震荡培养过夜;将1.5ml过夜培养物转入微量离心管中,于4℃以12000rpm离心1min弃上清;加入100ul预冷的solution I,涡旋震荡以悬浮沉淀;加入200ul新配制的solution II,盖紧管口,快速颠倒数次,于冰上放置5min;加入150ul冰冷的solution III,轻轻混匀,于冰上放置3-5min;4℃以12000rpm离心5min,将上清转移到另一离心管中;加入等体积的苯酚:氯仿:异戊醇(25v:24v:lv)抽提,混匀后于4℃以12000rpm离心5min,将上清转移到另一离心管中;加入2倍体积的无水乙醇,混匀后,置室温下10min;于4℃以12000rpm离心5min,弃上清,用70%乙醇洗涤DNA沉淀后,溶于适量的TE buffer,加入1ul 10mg/ml RNAaes,37℃处理1h,重复抽提回收,置-20℃贮存备用 3酶切 根据质粒上的多克隆位点选择BamHⅠ酶进行酶切。 然后进行琼脂糖凝胶电泳,ug的载体DNA和3-5倍等摩尔量的外源DNA;加入1ul 10X T4 DNA Ligase buffer和1 Weiss 单位的 T4 DNA Ligase;加入适量的超纯水,使总体积为10ul;混匀后于16℃连结过夜 5转化和筛选 制备大肠杆菌感受态细胞(参实验书) 热激法转化大肠杆菌 取100μl感受态细胞悬浮液中放到在冰里预冷的薄壁管中,如果是从超低温冰箱取出的感受态细胞悬浮液,则将其放在冰上解冻。 1μl质粒溶液加到上述感受态细胞悬浮液中,轻轻摇匀。然后在冰水浴中放置10~20min.。 薄壁管转入42条件下(如水浴锅)热激90sec。 速将薄壁管转入冰水浴中,放置2min.。 从冰水浴中取出薄壁管,往管中加入ml LB培养基,然后在摇床上37摇

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