DNA超分子水凝胶的粗粒化建模与模拟王曦黎明叶方富周-物理学报.PDFVIP

DNA超分子水凝胶的粗粒化建模与模拟 王曦 黎明 叶方富 周昕 ModellingandsimulationofDNAhydrogelwithacoarse-grained model WangXi LiMing YeFang-Fu ZhouXin 引用信息Citation: ActaPhysicaSinica, ,150201(2017) DOI: 10.7498/aps.66.150201 在线阅读Viewonline: /10.7498/aps.66.150201 当期内容Viewtableofcontents: /CN/Y2017/V66/I15 您可能感兴趣的其他文章 Articlesyoumaybeinterestedin 超高应变率载荷下铜材料层裂特性研究 Spallbehaviorofcopperunderultra-highstrainrateloading 物理学报.2017,66(4): 040202 /10.7498/aps.66.040202 单层二硫化钼纳米带弛豫性能的分子动力学研究 Moleculardynamicsstudyonrelaxationpropertiesofmonolayer MoS nanoribbons 物理学报.2016,65(16): 160201 /10.7498/aps.65.160201 碳纳米管中水孤立子扩散现象的模拟研究 Simulationstudiesonthediffusionofwatersolitonsincarbon nanotube 物理学报.2016,65(14): 140202 /10.7498/aps.65.140202 碳纳米管阵列水渗透性质的研究 Waterpermeabilityincarbonnanotubearrays 物理学报.2015,64(23): 230201 /10.7498/aps.64.230201 高应变率压缩下纳米孔洞对金属铝塑性变形的影响研究 Plasticdeformationinnanoporousaluminumsubjectedto high-rate uniaxial compression 物理学报.2015,64(17): 170201 /10.7498/aps.64.170201 物理学报 Acta Phys. Sin. Vol. 66, No. 15 (2017) 150201 DNA超分子水凝胶的粗粒化建模与模拟 王曦 黎明 叶方富 周昕 1) (中国科学院大学物理科学学院, 北京 100049) 2)(中国科学院物理研究所, 北京 100190) ( 2017 年3 月25 日收到; 2017 年4 月26 日收到修改稿) DNA 超分子水凝胶在生物、医学领域具有广阔的应用前景, 基于计算模拟技术研究其分子结构与其宏观 性能关系具有重要意义. 归因于其复杂的结构和较大的相关时间空间尺度, 目前针对DNA 水凝胶的分子建 模与模拟研究比较缺乏. 本文建立了一种DNA 水凝胶的粗粒化模型, 采用分子动力学模拟的方法针对一种 模块化纯DNA 水凝胶进行了研究. 模拟结果表明其凝胶态介观结构为多孔海绵状, 其交联度与水凝胶的浓 度成正相关, 并得出了其转变温度的范围等. 模拟结果与相关实验定性或半定量符合, 表明该模型可能用于 该模块化DNA 水凝胶等类似系统的结构功能关系研究. 关键词: DNA 水凝胶, 粗粒化模型, 分子动力学模拟, 液态-胶态转变 PACS: 02.70.Ns, 82.39.Pj, 87.14.gk DOI: 10.7498/aps.66.150201 DNA 超分子水凝胶具有重要意义. 1 引 言