动物生理生态学.pptxVIP

The title 讲解人： 程 红 contents 1 2 3 Summary Materials and methods Results 4 Key-words 5 Conclusions Summary 海洋潮间带的特点是温度的大幅度变化、pH值、溶解氧气、营养和食物供应在时间尺度上的变化。这些主要通过生理机制，来驱动生态过程（竞争等）。 这里我们利用转录组分析，在不同空间尺度上了解贻贝的生理反应机制。我们使用居住在不同的垂直位置的贻贝，在 BB（ Boiler Bay）SH( Strawberry Hill )的基因表达的变化。 结果显示两个截然不同的基因表达特征，代谢活动的循环和细胞内稳态扰动，在空间尺度上相距0.65公里的海域间显示出较大差异，主要来自食物和环境压力的影响。 环境控制基因的表达，这些新见解可以理解重要的生理内部驱动器，这种见解可以跨群体。 Key-words Key-words: biogeographical distribution, DNA microarray, ecological genomics, environmental stress, gene expression, mussels, spatial variation 关键词：生物地理学分布，DNA微阵列，生态基因组学，环境压力，基因表达， 贻贝，空间变化 通俗的名字是基因芯片（gene chip）。是一块带有DNA微阵列（micorarray）涂层的特殊玻璃片，在数平方厘米之面积上安装数千或数万个核酸探针，经由一次测验，即可提供大量基因序列相关资讯。它是基因组学和遗传学研究的工具。研究人员应用基因芯片就可以在同一时间定量的分析大量(成千上万个)的基因表达的水平，具有快速、精确、低成本之生物分析检验能力 Introduction 沿着俄勒冈海岸贻贝的基因表达模式以及生理反应可能有多个相互作用的复杂的非生物因素。 温度（特别是体温）和食物已经被证明是最重要的影响生存、生长和繁殖的两个因素。理解底层机制（体温和食物供应）驱动有机反应和生理性能越来越必要。像气候变化改变生境温度，先前的研究关于有机体和生态之间的联系及其细胞反应很大程度上是观察，范围有限，少量的非生物和生物因素,如热休克蛋白或相对基本的生理状态的代理,如增长率,体型,生殖输出和死亡率。 现在，全基因组分析的框架内进行生态环境允许我们检查多个驱动和有机反应的相互作用。 Materials and methods 1. TIDAL HEIGHT MEASUREMENTS (潮汐高度测量) 确定在垂直立面的低、中、高潮汐区使用的测量方法，用当地潮汐基准面，以确保贻贝类似年度浸没时间。对应于海拔0 m北太平洋东部海岸,有机体淹没90%的时间。 2.MUSSEL BODY TEMPERATURE ESTIMATES (贻贝体温估计) 3.CHLOROPHYLL-A MEASUREMENTS (叶绿素a测量) 量化浮游植物（贻贝主要的食物）的丰富度 样本收集→贻贝温度记录器的嵌入（安全插入每个贻贝）→每隔10分钟记录一次 Materials and methods 4.SAMPLE COLLECTION (样品收集) 贻贝样品：中午低潮时，同一地点，水平横断面的3个垂直高度上，每个高度取10个贻贝 测量叶绿素a的样品：量化浮游植物的丰度，不透明塑料250毫升瓶，在垂直高度取，每隔10分钟测（在研究期间—4月至9月） 5.COMPARISON OF GENE EXPRESSION PROFILES （基因表达谱的比较） 6.NORMALIZATION AND STATISTICAL ANALYSIS OF MICROARRAY DATA （归一化和微阵列数据的统计分析） Results 1.TIDAL HEIGHT SURVEYS （潮汐高度调查） 贻贝取样在BB和SH河蚌由调查决定海拔高度如下: BB-mid (1.44 ± 0.59 m), BB-high(1.68 ± 0.69 m)； SH-low (1.00 ±0.42 m), SH-mid(1.75 ± 0.72 m) and SH-high (2.07 ± 0.85 m) 2.BODY TEMPERATURE ESTIMATES （体温的估计） 文中说：由于部分数据丢失，所以只做了如下数据， 但同样能反应探讨的问题。 Results 2.BODY TEMPERATURE ESTIMATES （体温估计） 5天中，与SH-mid相比,BB-mid贻贝显示更大的温度差异；每日最低温度都是两个点,在11至14℃之间不等； 但是，在