中国部分黄牛BoLA基因多态性与生产性能的相关分析研究.pdfVIP

中文摘要 中国部分黄牛BoLA基因多态性与生产性能的相关分析 (摘 要) 本实验以秦川牛、鲁西牛、南阳牛、晋南牛四个品种的163头牛为研究对象，采用 PCR-RFLP和SSCP方法，结合克隆测序分别研究了MHC的DRB3基因第二外显子和 DRA基因第二外显子的分子遗传变异，并运用最小二乘线性模型，对所发现多态位点 与牛的生产性状进行了相关分析，结果如下: DRB3基因第二外显子在不同品种牛群体之间的优势基因型和优势等位基因不同， 在位点上，从整个群体来看，优势基因型为AB和BC;秦川牛、南阳牛、鲁西牛群体 中B,C为优势基因，晋南牛群体中A为优势基因。在MspI-RFLP位点上，秦川牛、 南阳牛和晋南牛群体中的优势基因型为AB，鲁西牛群体中的优势基因型为BB。四个群 体中，A,B等位基因所占的比例接近1:1，但是基因B略占优势。在RFLP-Tagl位点 上四个品种都不存在多态。经过XT适合性检验，在DRB3基因第二外显子的研究中， HaeIII酶切位点上，南阳牛未达到Hardy-Weinberg平衡状态;Msp工酶切位点上，鲁西 牛未达到Hardy-Weinberg平衡状态。 DRA基因第二外显子的SSCP分析中，秦川牛和晋南牛群体的优势基因型为AF, 优势基因为A;鲁西牛中的优势基因型为BC，优势基因为B;南阳牛群体中优势基因 型为BF，优势基因为B。经过x2适合性检验，秦川牛、晋南牛和南阳牛在DRA基因第 二外显子的SSCP分析中，基因频率和基因型频率均未达到Hardy-Weinberg平衡状态。 秦川牛、鲁西牛、南阳牛和晋南牛四个群体中，在DRB3-HaeII工位点和DRA基因 SSCP位点上，四个品种牛群的多态信息含量都达到高度多态(P工C0.50)，在DRB3-Msp工 位点上，四个品种牛群的都达到中度多态 (0.25P工C0.5)，说明这两个基因座位在四 个群体中的多态性高，遗传变异大。 本实验检测到了DRB3基因第二外显子的第18,19,24,26,64,65,75,76, 96,97,127,135,146,154,155,157,165,167,188,196,199,207,208,209, 217,219,220,241,242,245,246位发生了突变，其中154,155,157,165,167 位的突变使得该位点产生多态，可见，DRB3基因的第二外显子具有高度多态性。 通过DRA基因第二外显子的SSCP分析和克隆测序，检测到第 116位有一个G--A的 点突变;第197位有一个T--C的点突变，由此可见，DRA基因为相对保守，多态性不 高。 在对四种中国地方黄牛基因多态性与生产性状相关性研究方面，鲁西牛和秦川牛的 体重、体尺年龄效应明显，标记效应不显著，而南阳牛在6.12月龄时DRB3基因exon2 的标记效应均不显著，18月龄时体长Haelll-RFLP标记效应显著:在体高方面，2岁南 阳牛的DR、基因exon2的SSCP标记效应显著，3岁南阳牛的DRA-SSCP和DRB3-Msp T-RFLP标记效应显著。在DRB3基因exon2的Haefll-RFLP位点，AC基因型对体尺 中国部分黄牛BoLA基因多态性与生产性能的相关分析 有显著效应，在MspI-RFLP标记和BRA基因exon2的SSCP标记，其所有基因型对 体重、体尺指标影响不大。 BOLA:PCR-RFLP,SSCP 关键词:牛;生产性能:分子标记; RELATIONSHIPALALYSISOFTHEPERFORMANCEAND POLYMORPHISM OFBOLAINCHINESECATTLE (Abstract) Fourcattlebreeds,includingQinchuan,Luxi,Nanyang,Jinnan,wereusedas experimentalpopulation,whichwerestudiedusingPCR-RFLPandSSCP.Geneticvariation intheexon2ofDRB3andexon2ofDRAofbovineMHCwerestudiedi