整合素αvβ3受体拮抗剂药效团模型的研究pharmacophore-药学学报.pdf

药学学报 Acta Pharmaceutica Sinica 2009, 44 (4) : 379385 ·379 · 整合素 β 受体拮抗剂药效团模型的研究 v 3 程刚英，倪广慧，姜凤超* (华中科技大学同济医学院 学院 物化学系，湖北 武汉 430030) 摘要: 为构建可靠的整合素 β 受体选择性拮抗剂的 效团模型并根据模型设计小分子活性化合物，选择 v 3 对 β 受体具有较高抑制活性（IC 110 nmol L 1 ）的4 个类型（分别以酰胺、哌嗪、哌啶、γ-戊内酰胺为中 v 3 50 间连接基）的30 个化合物为训练集，利用Catalyst 软件构建整合素 β 受体选择性拮抗剂 效团模型，并在数 v 3 据库中寻找具有活性的母体结构，对母体结构进行修饰和改造及类 性分析得到先导化合物。得到的 效团模 型相关系数好、预测能力高，可较准确的预测相关化合物的活性。优化模型含 1 个芳环中心 （RA ）、1 个可阴离 子化部位 （NI ）和2 个疏水作用基（HP ），其相关系数与权重值分别为：RMS = 0.73, Correl = 0.90, Weight = 1.17, Config = 14.00 。所设计的目标化合物预测活性强且结构简单，易于合成，噻唑类为未见报道的一类母体结构化 合物。 关键词: 药物化学； 效团；整合素 β ；拮抗剂 v 3 中图分类号: R916.2 文献标识码:A 文章编号: 0513-4870 (2009) 04-0379-07 Pharmacophore model of integrin β antagonists v 3 * CHENG Gang-ying, NI Guang-hui, JIANG Feng-chao (Depa rtment of Medicinal Chemistry, School of Pharmacy, Tongj i Medical College of Huazhong University of Science and Technology, Wuhan 430030, China) Abstract: In order to generate a pharmacophore model of integrin β receptor antagonists and design lead