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生物化学--第十一章 DNA复制RNA转录-DNA复制
第十章 DNA的复制和修复 第一节 半保留复制 第二节 参与DNA复制的酶与蛋白质 第三节 复制过程 第四节 DNA损伤及修复 几个相关概念: 1. 复制起始点 (origin, ori) 原核生物只有一个复制起始点; 真核生物染色体DNA有多个复制起始 点,同时形成多个复制单位, 两个起始点 之间的DNA片段称为复制子(replicon)。 2. 复制叉 (replication fork) 复制时双链打开,分开成两股,新链沿 着张开的模板生成,复制中形成的这种Y 字形的结构称为复制叉。 三、DNA复制的起点和方向 复制中的大肠杆菌染色体放射自显影图(Caims实验) 四、复制特点 半不连续复制 半保留复制 DNA的半不连续复制复制过程 第二节 参与DNA复制的酶与蛋白质★ 复制相关蛋白的基因:dna A、dna B、dna C… …dna X 相应的表达产物蛋白质:Dna A、Dna B、Dna C … …Dna X Dna A:辨认复制起始位点 Dna B:解螺旋酶 Dna C:辅助解螺旋酶使其在起始点上 结 合并打开双链。 一、DNA聚合酶★ (一)催化的反应特点★ 以四种dNTP为原料 需要模板 需要引物 催化反应方向为5’-3’ 产物性质与模板链相同 (二)大肠杆菌三种DNA聚合酶比较 DNA聚合酶 I 5? ? 3 ?聚合酶功能 聚合反应机理: DNA聚合酶的3′- 5′外切酶水解位点 DNA聚合酶5′- 3′外切酶活力 DNA-pol I: 曾被称为复制酶(replicase) 含量最多 可被水解成两个片段 小片段(N端):具有5′→3′外切酶活性; 大片段(C端):具有聚合活性和3′→5′ 外切酶活性,也称为Klenow片段,是常用的工具酶。 DNA-pol III: 由10种亚基组成的不对称聚合体 催化效率最高 大肠杆菌DNA聚合酶Ⅲ全酶的结构和功能 二、解旋酶(解超螺旋,也叫拓扑异构酶、DnaB蛋白) ①连环数(linking number , L) DNA双螺旋中,一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数 ②扭转数(twisting number , T) DNA分子中的Watson-Crick螺旋数目,以T表示 ③超螺旋数(缠绕数 , writhing number , W) 三、解链酶( DnaA蛋白) 四、SSB 五、引物酶 六、DNA连接酶 解螺旋/链 酶 (helicase) ( DnaA蛋白) : 模板对复制的指导作用在于碱基的准确 配对,而碱基却埋在双螺旋的内部。只有把DNA解开成单链,它才能起模板作用。 解螺旋酶是最早发现的与复制有关的蛋 白质,当时称为rep蛋白。作用是利用ATP供 能,解开DNA双链。 四、SSB SSB曾被称为螺旋反稳定蛋白(HDP)。 SSB与解开的DNA单链紧密结合,防止 重新形成双链,并免受核酸酶降解。在复制中维持模板处于单链状态。 引物酶 (primase): 依赖DNA的RNA聚合酶。 催化RNA引物的合成。 在大肠杆菌,引物酶是dna G基因的产物。 RNA引物: 在DNA模板的复制起始部位由引物酶催 化NTP的聚合,形成短片段的RNA,为DNA 聚合提供3′-OH末端。 连接酶连接切口 大肠杆菌和其它细菌的DNA连接酶要求NAD+提供能量;在高等生物和噬菌体中,则要求ATP提供能量。 DNA连接酶在DNA复制、损伤修复、重组等过程中起重要作用。 第三节 复制过程 一、复制起始 二、链的延长(冈崎片段的合成) 三、复制的终止 引发体 (primosome): 是由Dna B、Dna A、Dna C以及其他复制 因子一起形成复合体,再结合引物酶形成 较大的聚合体,结合到模板DNA上。 冈崎片段引物的切除、缺口的填补和切口的连接: 引导链与随从链分别由哪些酶或蛋白参与? 三、复制的终止 DNA忠实性的保障 真核细胞内有五种DNA聚合酶 真核和原核DNA细胞复制比较 真核细胞DNA复制的特点 端粒酶(telomerase) 特点: 1. 由RNA和蛋白质构成的复合物 2. 为特殊的逆转录酶,能以自身的RNA为 模板逆转录合成端粒DNA 功能: 合成端粒DNA,维持端粒的长度 爬行模型: 端粒合成的一种模型 第四节 DNA损伤及修复 DNA紫外线损伤的光裂合酶修复 切除修复 DNA的重组修复 SOS修复: 这是一种在DNA分子受到较大范围损伤
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