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合成路线书写原则
1. 路线整理过程总体要求 要求所画分子结构要整齐美观每一横行必须左对齐且每个横行之间的距离不能太大如例1所画结构不能带有CH、CH2以及CH3的书写形式。符合化学键的键角键长要用ACS document 1996为模板打开chemdraw→File→Apply Document Settings from→ACS Document 1996例1 各个路线Chemdraw规定宽度为24格打开chemdraw→view→show crosshair和show rulers帮助确认宽度 3. 反应初始原料若有两个或多个且都画出结构时A+B+C的形式例2所示后面步骤将所用试剂放在箭头上面例2 4. 同一目标化合物的所有路线目标产品和中间体结构中原子和基团的空间排布顺序从头到尾一般要一致。 . 同一横行的所有化合物结构中心和箭头要在一个水平线上同样,化合物编号也要在同一水平线上。方法选择要对齐的结构加号和箭头右键→align→T/B centers。 化合物编号(或名称)以及ee或de值书写顺序为:编号(或名称)→ee或de值(均为斜体),居中,最终产品所得量不必标出,如例3。 3 产物名称包括路线后面缩略词的注释,每个单词的首字母都要大写 6. 有中间体需要单独合成在主路线后面单独以虚线隔开虚线宽度为文档宽度的一半为12格常规转化的中间体的合成若少于三步一般。 所合成的中间体的编号与主路线编号相同其他化合物的编号接主路线的编号依次往下排序如4中,依次排序,辅路线涉及中间体8合成路线编号为13依次后编,产物8。 例4 7. 关于产率及多步反应的总收率计算条件相当多步收率例5第三步应写为0% over 3 steps,放在第三步箭头下面或箭头下条件后面,居中,不应放在第三步化合物编号下面,注意3字要用阿拉伯数字表示,而非英文three。如可能,每步一般都要写出收率,文献已标明直接写明,若文献未直接标明,如给出所有原料和试剂的投料量,和该步中间体的产量,应由此计算出相应的收率。对于箭头上几步反应条件的情况,如果中间体经过猝灭初步提纯等后处理拿到产物后投入下步反应的,箭头下面的产率要写为XX% over x steps;若不经过后处理而直接投入下步反应,则直接如例5所示。 5: 关于总收率算法一条路线总收率为各步骤收率乘积若一条路线中含有副路线路线终产物是主路线箭头上所需的反应试剂总收率应全部算一起。若路线终产物是主路线中间体另一合成方法路线总收率计算不包括路线收率。 8对于含有手性中心的活性化合物,要用键或表示,楔形键小端位于手性原子上大端一般指向(杂原子则优先选择指向杂原子。若为消旋,则用表示用表示如存在环状结构,手性优先画在环上化合物的书写规则,手性画在取代基上,而非画在上例。 例7 对映体ee值以及非对映体de值和比旋光度计算及说明标出或中间体光学纯度为%,则需要的值为%-3%)/100%=94% ee。若给出比旋光度,一般表示为[?]D20 = +59.5 (c 2.06, MeOH),注意D为斜体,等号前后都要空一格。置于化合物编号下面,居中。 9. 关于反应条件书写 反应过程所用条件分配包括试剂溶剂温度以及压力等写在箭头上下箭头和反应条件的距离不能太大反应时间不用写。条件文本与箭头的距离可参考例8注意带有数字下角标和下行的字母如q, y, p等避免与箭头重合!例8 箭头要比反应条件文本框稍微长一点箭头两端都要留一些空间。 各个条件文本之间用逗号加空格隔开。9。 例9 凡是条件为全称时首字母都要大写如甲苯、二氧六环和微波以及结晶柱层析等分别用TolueneDioxane、Microwave、Crystallized、Silica gel chromatography、Chiral chromatography (Chiral-HPLC)、1.6N n-BuLi in Hexane(参见例1~4,对10,4N HCl in Dioxane,又如48% HBr in HOAc。 例10 化合物名称如具有定位原子或位置编号时,首字母无需大写,如N-methoxy-N-methylacet amide,2,3-dimethoxy- butane,tert-isoamyl acohol。 对于不常见的缩略词要加注释全称置于整条路线下面若画出结构式则必须放在箭头上方居中。 如果一步反应分几步加料或几步反应串联反应或一锅法时为起始进行以 i. ii. iii. …. 表示左对齐序号与之间无空格,与文本之间空一格11所示。 例11 反应条件中涉及气体或液体反应,如氯化氢气体液氨等应标注在所用试剂的后面表示为HCl(g)NH3(l)形式试剂名称与括号之间无空格。 12。 例12 10. 关于温度的书写 如例13。 例13 11. 关于斜体
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