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分子生物学-第六讲RNA转录
E. coli RNA polymerase 2、 RNA聚合酶的进入位点 E.Coli各σ识别的启动子的序列 远距离效应 无方向性 顺式调节 具有组织特异性 ? 抗终止的机制 依赖于噬菌体本身的依赖ρ因子的终止子 依赖ρ因子的终止子上游有抗终止信号(靠近PL 的nutL,靠近tR1的nutR nut—PN utilization) 抗终止蛋白和nut位点的结合,等待RNApol经过 时修饰RNApol的构象,拮抗寄主编码的终止蛋白ρ的活性,使之通过那些依赖ρ的终止子 真核与原核生物mRNA的特征比较 原核生物mRNA的特征 1、原核生物mRNA半衰期短 2、原核生物mRNA大多以多顺反子存在 3、原核生物mRNA无帽子结构,无或有较短polyA结构 真核生物mRNA的特征 1、有帽子结构 2、绝大多数真核生物mRNA具有polyA尾巴 核酶 Ribozyme 是一类具有催化功能的RNA分子,通过催化靶位点RNA链中磷酸二脂键的断裂,特异性地剪切底物RNA分子,从而阻断基因的表达 六RNA编辑 概念:某些RNA,特别是mRNA前体的一种加工方式,如插入、删除或取代某些核苷酸残基,导致DNA所编码的遗产信息改变,因为经过编辑的mRNA序列发生了不同于模板DNA的变化。 C-U;U-A;U-C;A-I; 三、第二类内元的拼接 1、拼接点序列 7核苷酸的保守序列 (Branch Site ) 3’ 拼接点上游 6bp ~ 12bp 处 ● 5’----exon----- GUGCG---------B.S----Py AU ----exon---3’ 供点 受点 ----Py Pu Py Py U A Py--- 100% 2、拼接机制(Splicing mechanism) Int ron IR IR A 5’ G AU 3’ Exon 1 Exon2 G A intron PyAU Matural RNA “Lariat” intron 套索状内元 转酯攻击位点 intron OH AU 2‘ A 3‘ G 剪切型核酶 剪接型核酶 五、核基因mRNA内元的拼接 1、相关概念 Euk.的细胞中,有许多碱基数在100 ~ 300之间 的小分子RNA,每个细胞有 105~106个 snRNA: 细胞核中的 (snRNP) scRNA: 细胞质中的 (scRNP) 2、核mRNA内元拼接的结构特点 内元拼接与其他加工同时进行 拼接点序列 Breathnach-Chambon rule (GU-AG规则) ● 5’---exon--- GU--------intron--------AG ------exon----3’ 供点 100% 94% 受点 ● 7Nt branch site 3’拼接点的上游 py X py U pu A py 3、拼接机制(Splicing mehanism ) ● SnRNA (or ScRNA) 与拼接点序列间存在互补区域 并参与剪接, 形成拼接体( spliceosome)。 ● Spliceosome 逐级组装, SnRNA(U1、U2、U5和 U4/U6)分步替代 ● U1通过与 5’拼接点互补而结合 U2识别并结合分支 点A U1和U2作用使内元的 5’端和 3’端带到 一起(U1与 3’拼接点配对) U1、U2、mRNA与
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