玉米耐盐基因zmhkt1的序列变异分析-玉米科学.pdfVIP

玉 米 科 学2015，23(5)：39～48 JournalofMaizeSciences 文章编号：1005-0906(2015)05-0039-10 DOI:10.13597/ki.maize.science 玉米耐盐基因ZmHKT1的序列变异分析 1 1 1 2 1 1 姜志磊 ，姜 昱 ，刘艳芝 ，蒋 超 ，金峰学 ，李毅丹 (1.吉林省农业科学院农业生物技术研究所，长春 130033；2.吉林农业大学生命科学学院，长春 130118) 摘 要：HKT(High-affinitypotassiumtransporter，高亲和性钾转运蛋白)基因所编码的蛋白能起到维持植物体内 + + + 的Na/ K平衡的作用。在作物中HKT蛋白主要通过排出叶片中的Na ，从而提高植物耐盐性。对54份玉米自交系 材料的ZmHKT1基因及上游序列进行多态性分析。结果表明，在3784bp的序列中，共有194个SNP和32个InDel。 大部分变异集中在基因上游序列和内含子区，编码区的变异相对较少，说明编码区在进化和人工选择中承受了更大 的选择压力。根据序列变异情况可将54份玉米自交系材料划分为15个单倍型，上游序列主要存在3种单倍型，而 基因序列存在9种单倍型。遗传重组和连锁不平衡分析发现，全长序列只有3次重组事件发生，上游序列存在着非 常强的连锁不平衡。 关键词：玉米；ZmHKT1基因；单核苷酸多态性(SNP)；InDel；连锁不平衡；单倍型 中图分类号：S513.035.3 文献标识码：A NucleotideDiversityofDroughtToleranceRelatedGeneZmHKT1 1 1 1 2 1 1 JIANGZhi-lei,JIANGYu,LIUYan-zhi,JIANGChao,JINFeng-xue,LIYi-dan (1.Agro-BiotechnologyResearchInstitute,JilinAcademyofAgriculturalSciences,Changchun 130033; 2.SchoolofLifeSciences,JilinAgriculturalUniversity,Changchun 130118,China) Abstract:HKT(high-affinitypotassiumtransporter)genesareknowntobeimportantintheregulationofNa+ + andK transportationinhigherplants.Incrops,themajorcontributionoftheHKTinsalttoleranceistheexclusion + ofNa fromleaves.InordertoillustratethesequencepolymorphismofmaizegeneZmHKT1,theZmHKT1genesin 54 maizeinbredlinesweresequenced,usingthesequenceofB73 asthereference.Onehundredandninety-four SNPsandthirty-twoInDelswereidentifiedinthe 3784bpnucleotidesequencesofZmHKT1.Mostofthesepoly⁃ morphicsi