水稻mrna多聚腺苷化信号位点的序列分析.pdfVIP

51 7 2006 4 mRNA * 陆 颖①② 高晨曦①②③ 韩 斌①③ (① 中国科学院上海生命科学研究院国家基因研究中心, 上海 200233; ② 中国科学院研究生院, 北京 100039; ③中国科学院上海 生命科学研究院植物生理生态研究所, 上海 200032. * 联系人, E-mail: bhan@) mRNA mRNA / , 3′- 大部分真核生物 的加工涉及到 前体的分裂多聚腺苷化 在 末端形成多聚腺苷 酸(poly(A))尾巴. 为了研究水稻mRNA 前体多聚腺苷化过程所必需的poly(A)加尾信号、下游调控元件 和poly(A)位点等序列的特点, 用3′-末端带有poly(A) 的EST 与全长cDNA 序列进行比较, 建立了一个 来自9953 个基因的、覆盖 12969 条poly(A)位点两侧各40 碱基序列的数据库. 结果发现, 只有7.9%的 mRNA AAUAAA , 60% AAUAAA 1~2 , 使用 作为加尾信号 超过 使用 的 个碱基变化的序列作为加尾信号 11.5% mRNA AAUGAA . 25% mRNA 3′- 的 使用 及其单碱基变化的加尾信号 在约 的 的 末端存在多个 poly(A) . 90% mRNA U/GU , 位点 在 的 前体的加尾信号下游都能检测到富含 的调控元件 尤其在以 AAUAAA 的多碱基变化序列作为加尾信号的mRNA 前体中, 半数以上都能在poly(A)位点两侧检测到 . , poly(A) . , mRNA 下游调控元件 而且 这些调控元件的位置对 位点的选择有限制作用 总之 虽然水稻 , . 加尾信号的保守性较低 但大量下游调控元件的存在保证了多聚腺苷化过程的正常进行 水稻 表达序列 RNA 剪接 多聚腺苷化 大部分真核生物mRNA 前体(pre-mRNA)在剪接 列的发表[10], 使我们有可能利用基因组的精确序列 , 3′- , 和cDNA 序列中3′-非翻译区(3′-UTR) 的序列全面分 之前 都是先在其 末端的某个位置切开 再进行 多聚腺苷化(polyadenylation), 形成多聚腺苷酸 析水稻mRNA 的PAS 和DUE 以及它们对poly(A)位 [1,2] . PAS, DUE