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功能基因组学讲义
培训日程:
日期 时间 授课题目 授课内容
10:00-18:00 报到
5 月16 日
14:00-18:00 预装软件
08:30-09:00 开班仪式 预装软件、调试网络;合影
基因本体(GO )及KEGG Pathway 分
09:00-11:30 基因功能注释数据库
5 月17 日 析;上机实践
应用在线工具 DAVID/WebGestalt 进
14:00-18:00 基因集功能富集分析
行功能富集分析;上机实践
应用在线工具 Rfam/miRBase 查询
microRNA 序列查询
08:30-11:30 miRNA 序列;TargetScan/miRecords
与靶基因预测
预测miRNA 靶基因;上机实践
5 月18 日 应用 ArrayTools 软件进行数据预处
基因芯片数据处理与 理;Cluster/Treeview 软件进行聚类分
14:00-17:00
分析 析;在线工具FunNet 进行共表达网络
分析;上机实践
应用 Cytoscape 软件进行基因注释、
系统生物学网络结构
08:30-11:00 基因表达及分子间相互作用分析;上
5 月19 日 分析
机实践
11:00-11:30 结业仪式 颁发结业证书;自由讨论与答疑
目录
基因功能注释数据库……………………………………….……………………1
基因集功能富集分析………………………….…………….…………………21
microRNA 序列查询与靶基因预测……………………………………44
基因芯片数据处理与分析……………………………………………………63
系统生物学网络结构分析……………………………………………………85
2014/5/13
功能基因组信息分析技术
伦永志
大连大学医学院
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联系方式
大连大学医学院 医学研究中心 lunyz@163.com
0411
概述
功能基因组学即后基因组学,利用结构基因
组所提供的信息和产物,通过在基因组或系
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