功能基因组学讲义.pdf

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功能基因组学讲义

培训日程: 日期 时间 授课题目 授课内容 10:00-18:00 报到 5 月16 日 14:00-18:00 预装软件 08:30-09:00 开班仪式 预装软件、调试网络;合影 基因本体(GO )及KEGG Pathway 分 09:00-11:30 基因功能注释数据库 5 月17 日 析;上机实践 应用在线工具 DAVID/WebGestalt 进 14:00-18:00 基因集功能富集分析 行功能富集分析;上机实践 应用在线工具 Rfam/miRBase 查询 microRNA 序列查询 08:30-11:30 miRNA 序列;TargetScan/miRecords 与靶基因预测 预测miRNA 靶基因;上机实践 5 月18 日 应用 ArrayTools 软件进行数据预处 基因芯片数据处理与 理;Cluster/Treeview 软件进行聚类分 14:00-17:00 分析 析;在线工具FunNet 进行共表达网络 分析;上机实践 应用 Cytoscape 软件进行基因注释、 系统生物学网络结构 08:30-11:00 基因表达及分子间相互作用分析;上 5 月19 日 分析 机实践 11:00-11:30 结业仪式 颁发结业证书;自由讨论与答疑 目录 基因功能注释数据库……………………………………….……………………1 基因集功能富集分析………………………….…………….…………………21 microRNA 序列查询与靶基因预测……………………………………44 基因芯片数据处理与分析……………………………………………………63 系统生物学网络结构分析……………………………………………………85 2014/5/13 功能基因组信息分析技术 伦永志 大连大学医学院 LOGO 联系方式 大连大学医学院 医学研究中心 lunyz@163.com 0411 概述 功能基因组学即后基因组学,利用结构基因 组所提供的信息和产物,通过在基因组或系

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