甘肃西峰黄土中细菌16srdna文库的构建与组成初步分析-兽类学报.pdfVIP

2012 年 12 月，第 18 卷，第 4 期，765-772页 高 　校　地　质　学　报 December 2012，Vol. 18，No.4， p. 765-772 Geological Journal of China Universities 甘肃西峰黄土中细菌16S rDNA文库的 构建与组成初步分析 1 1* 2 2 1 1 黄 晟 ，陈 ，潘雪莲 ，崔益斌 ，季峻峰 ，陈 骏 1. 表生地球化学教育部重点实验室，南京大学 地球科学与工程学院，南京 210093 ； 2. 污染控制与资源化研究国家重点实验室，南京大学 环境学院，南京 210093 摘要：对黄土高原西峰地区黄土沉积物中的有机质进行了总 DNA 提取和 PCR（聚合酶链式反应）扩增，通过克隆测序技 术构建了含有 44 个克隆子的细菌 16S rDNA 文库。对 16S rDNA 系统发育的分析表明，西峰地区的黄土沉积物中细菌可分属 13 个类群，包括：酸杆菌（Acidobacteria）、变形菌（Proteobacteria）、放线菌（Actinobacteria）、绿弯菌（Chloroflexi）、厚壁 菌（Firmicutes）、疣微菌（Verrucomicrobia）、浮霉菌（Planctomycetes）、芽单胞菌（Gemmatimonadetes）、异常球菌—栖热菌 （Deinococcus-Thermus）、硝化螺旋菌（Nitrospirae）、蓝细菌（Cyanobacteria）、拟杆菌（Bacteroidetes）和 Candidate division TG1。其中酸杆菌为最主要优势类群，变形菌为次优势类群，二者占黄土细菌总克隆数的 70%，且大多为不可培养的基因型。 关键词 ：黄土；16S rDNA文库；细菌多样性；酸杆菌 中图分类号：P539.2　　　　　　　　文献标识码：A　　　　　　　　文章编号： 1006-7493（2012）04-0765-08 Construction and Preliminary Analysis of the 16S rDNA Clone Library of Bacteria in the Xifeng Loess Section, the Northwest of China HUANG Sheng1 CHEN Yang1* PAN Xuelian2 CUI Yibin2 JI Junfeng1 CHEN Jun1 1. Key Laboratory of Surficial Geochemistry (Ministry of Education), School of Earth Sciences and Engineering, Nanjing University, Nanjing 210093, China; 2. State Key Laboratory of Pollution Control and Resource Reuse, School of the Environment, Nanjing University, Nanjing 210093, China Abstract: The development of culture-independent techniques using nucleic acids has provided much new insight into studies of microbial diversity of soils. In this st