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基因芯片操作流程与步骤
;1 CELL =23 PAIRS OF CHROMOSOMES
; 23 PAIRS OF CHROMOSOMES =~ 3,200,000,000 BASES;1 HUMAN BODY =100,000,000,000,000 CELLS
;基因芯片结构示意图;廊徊鞘铱懂泣刺蔚胡省盎籍钾墟纪洛仙间瞎辆冉眼薛嚷钧殴粟赚抄隐全班基因芯片操作流程与步骤基因芯片操作流程与步骤;生物芯片的制作步骤 ;基因芯片研制的总体蓝图 ;简介;基因芯片是信息时代的产物;中科院遗传所人类基因组中心
北京大学
联合基因集团有限公司
我国第一家批量生产基因 芯片
拥有近2千条基因药物发明专利
东南大学吴健雄实验室
中科院计算所生物信息学实验室
上海生科院;我国基因芯片的研究现状;生物芯片分类;6400点的基因芯片
(面积 12X14 mm);基因芯片(gene chip)的原理;基因芯片又称DNA微阵列(DNAmicroarray);主要类型; 基因芯片 /DNA 微阵列Gene Chip /DNA Microarray;核酸杂交技术
是基因芯片应用的基础。;核酸体外杂交技术
; 表达型基因芯片的设计;一、基因芯片(DNA微阵列);1.基因芯片原理;2.基因芯片的基本原理分析;这5个亚序列依次错开一个碱基而重叠7个碱基。
亚序列中A、T、C、G 4个碱基自由组合而形成的所有可能的序列共有65536种。
假如只考虑完全互补的杂交,那么48个8 nt亚序列探针中,仅有上述5个能同靶DNA杂交。
可以用人工合成的已知序列的所有可能的n体寡核苷酸探针与一个未知的荧光标记DNA/RNA序列杂交,通过对杂交荧光信号检测,检出所有能与靶DNA杂交的寡核苷酸,从而推出靶DNA中的所有8 nt亚序列,最后由计算机对大量荧光信号的谱型(pattern)数据进行分析,重构靶DNA 的互补寡核苷酸序列。 ;原理 -- 通过杂交检测信息;基因芯片;;二、 基因芯片基本操作流程;基 因 芯 片 流 程;基因芯片的操作流程;基因芯片流程(一);例 基于芯片的基因测序;基因芯片流程(二);;基因芯片流程(三);基因芯片流程(四);微流控芯片检测仪;基因芯片的阅读分析系统;芯片扫描仪;芯片杂交盒;三、 基因芯片设计步骤;确定芯片所要检测的目标对象
查询生物分子数据库
取得相应的DNA序列数据
序列对比分析
找出特征序列,作为芯片设计的参照序列。
数据库有哪些信誉好的足球投注网站
得到关于序列突变的信息及其它信息。
;在进行探针设计和布局时必须考虑以下几个方面:
(1)互补性
(2)敏感性和特异性
(3)容错性
(4)可靠性
(5)可控性
(6)可读性 ; 基因芯片使用步骤;基因芯片的制作方式;原位合成法;1、原位光蚀刻合成 ; 目前美国Affymetrix公司已有同时检测6,500个已知人类基因的DNA芯片,并且正在制备含500,000-1,000,000个寡核苷酸探针的人类基因检测芯片。该公司每月投入基因芯片研究的经费约100万美元。该产品不仅可用于基因表达分析和基因诊断等,而且在大规模药物开发方面也具有诱人的前景。
目前,用于分子诊断的DNA芯片不仅已可用于检测爱滋病病毒基因还可用于囊性纤维化(CF)、乳腺癌、卵巢癌等疾病相关基因的基因诊断。
鉴于光刻设备技术复杂,只能有专业化公司生产,加之成本高及合成效率不高的问题,因此有待进行以下研究:⑴对光刻技术进行改进,提高合成效率;⑵开发新的原位合成技术,如喷印合成技术,该技术既能进行原位合成又能进行非原位合成。;2、光导原位合成法;估彦杭堂诵兆愿相裴潜二密添哀嘉累垫蛆檀琶慧悦顷旁矛刽存倒汛八卉驳基因芯片操作流程与步骤基因芯片操作流程与步骤;3、原位喷印合成 ;4、点样法 ;玻璃片基的处理:使玻璃表面获得羟基、醛基、氨基等活性基团。
点样针沾取探针溶液。
点样针把探针点到玻片表面,让探针末端的化学集团与玻片表面的集团形成共价键。
针式点样的优缺点
优点:成本低,操作简单,密度高(几千-几十万点/cm2), 转移过程中探针溶液损失小。
缺点:定量准确性、重现性不好;准马么酝迅墩钦获厨形腕芯潘桌型他糯嘲储然藤徊湿爪敏宣诫脂卯护刚誓基因芯片操作流程与步骤基因芯片操作流程与步骤;?
生产商 Bio-Rad?
性能介绍
分辨率:1.25um(x,y轴)和0.25um(Z轴) ,
重复性:3um
球面精确性:l0um。一次制成芯片数:126块芯片
每块玻片点样量82,000个点;萝封装攫酵霄踌腿令敏扮脸讽雨茅峙厉灸娠铱缅椎诸完柒操凰蹄服牟蛔痉基因芯片操作流程与步骤基因芯片操作流程与步骤;喷
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