Linux高性能计算集群及并行计算.PDF

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2017-06-15 发布于江苏
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Linux高性能计算集群及并行计算

. Linux高性能计算集群及并行计算李会民 hmli@ 中国科学技术大学网络信息中心超级运算中心 2012-11-24 . . . . . . 李会民 (中国科大超算中心) Linux高性能计算集群及并行计算 2012-11-24 1 / 112 内容 ... 1 高性能计算、超级计算、并行计算 ... 2 Linux在高性能计算领域的现状 ... 3 NFS ：网络文件系统 ... 4 NIS ：网络信息服务 ... 5 quota：磁盘配额 ... 6 kickstart ：网络批量系统安装 ... 7 ssh免输密码访问 ... 8 NTP ：网络时间服务 ... 9 内网客户端访问外网：iptables转发 ... 10 集群批量设置 ... 11 编译环境 ... 12 作业调度系统 ... 13 集群监控Ganglia ... 14 并行计算简介 ... 15 GPGPU计算简介 ... 16 联系信息 . . . . . . 李会民 (中国科大超算中心) Linux高性能计算集群及并行计算 2012-11-24 2 / 112 高性能计算、超级计算、并行计算高性能计算(HPC) 指通常使用很多处理器（作为单个机器的一部分）或者某一集群中组织的几台计算机（作为单个计算资源操作）的计算系统和环境。有许多类型的HPC系统，其范围从标准计算机的大型集群，到高度专用的硬件。大多数基于集群的HPC系统使用高性能网络互连，比如那些来自InﬁniBand或Myrinet的网络互连。基本的网络拓扑和组织可以使用一个简单的总线拓扑，在性能很高的环境中，网状网络系统在主机之间提供较短的潜伏期，所以可改善总体网络性能和传输速率。一般不区分高性能计算、超级计算、并行计算之间的差别。 (a) 天津超算：天河1A (b) 深圳超算：曙光星云 (c) 济南超算：