鸡lmbr1基因内含子多态与趾型的关联.docVIP

中 国 农 业 科 学 40卷 5期 黄艳群等：鸡lmbr1基因内含子多态与趾型的关联 中国农业科学 2007,40(6):1254-1259 Scientia Agricultura Sinica 收稿日期：2006-01-08；接受日期：2006-12-22 基金项目：国家重点基础研究发展规划项目（和河南省杰出青年基金（0612001700） 作者简介：黄艳群（1968-），女，四川眉山人，研究方向为家禽分子遗传。Tel:0371E-mail：hyanqun@；黄艳群与陈文对本 文有同等贡献。通讯作者李宁（1962-），男，江西南昌人，教授，博士，研究方向为动物分子遗传。Tel：010E-mail：ninglbau @ 鸡lmbr1基因内含子多态与趾型的关联 黄艳群1,2,3，陈 文1，邓学梅4，李 宁1,2，邱祥聘3，吴常信4 （1河南农业大学牧医工程学院，郑州 450002；2中国农业大学农业生物技术国家重点实验室，北京100094；3四川农业大学动物科技学院， 雅安 625014；4中国农业大学动物科技学院 ，北京100094） 摘要：【目的】多趾是丝羽乌骨鸡的品种特征之一，但其多趾发生的分子机制尚未知。Lmbr1基因是人和鼠轴前多趾的关键候选基因，其同源基因是否是鸡多趾表型的关键候选基因值得研究。【方法】本研究以多趾的丝羽乌骨鸡和四趾的白洛克肉鸡杂交建立的资源家系为研究素材，采用直接测序和PCR-SSCP相结合的方法进行了鸡lmbr1基因内含子13的克隆、多态分析及其在不同物种的序列保守性比较、单体型分析及单核苷酸多态与趾型的关联分析。【结果】从内含子13检测到4个SNPs，发现这些单核苷酸多态构成的单体型在丝羽乌骨鸡和白洛克肉鸡间的分布呈现明显的差异，PCR-SSCP基因型在资源家系亲代和F2代均呈现与趾型的显著关联。【结论】 鸡lmbr1基因内含子13变异与调控鸡多趾表型的特异性位点紧密连锁，鸡lmbr1基因应是鸡多趾表型的重要候选基因，今后应进一步加大鸡lmbr1基因全基因组水平和其临近区域基因的检测。 关键词：lmbr1基因；鸡；内含子；单核苷酸多态；多趾；关联性 The Association of Single Nucleotide Polymorphisms in Chicken Lmbr1 Intron with Chicken Polydactyl HUANG Yan-qun1,2,3, CHEN Wen1, DENG Xue-mei4, LI Ning2, QIU Xiang-pin3, WU Chang-xin4 (1College of Animal Science, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002; 2State Key Laboratory of Biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100094; 3College of Animal Science, Sichuan Agricultural University, Yaan 610015; 4 College of Animal Science, China Agricultural University, Beijing 100094 ) Abstract： 【Objective】 Polydactyl is one of the typical characteristics of Silkies, but the molecular mechanism of this traits is still unknown. Lmbr1 is the key candidate gene underlying human and mouse preaxial polydactyly(PPD). There is a need for further researching on whether lmbr1 is also a key candidate gene of chicken polydactyl. 【Method】Scientists conducted the cloning of chicken lmbr1 intron 13, using Single Nucleotide Polymorph