沙眼衣原体高分辨率溶解曲线基因分型方法建立及其在男男性行为者流行病学调查中应用.docx

导师组成员 陈祥生 尹跃平 姚煦  研究员 研究员 副主任医师 目录 缩略语………………………………………………．．１ 中文摘要………………………………………………２ 英文摘要………………………………………………５ 第一部分沙眼衣原体ｏｍｐＡ基因序列的分析和目的扩增片段的确定 前言………………………………………………９ 第一节１５种型别沙眼衣原体ｏｍｐＡ基因序列分析 材料和方法…………………………………………ｌＯ 结果………………………………………………１１ 讨论………………………………………………１６ 第二节沙眼衣原体标准菌株的复苏、培养和鉴定 材料和方法…………………………………………１７ 结果………………………………………………２１ 讨论??……………………………………………２２ 第三节沙眼衣原体标准菌株ｏｍｐＡ基因的扩增和序列分析 材料和方法…………………………………………２３ 结果………………………………………………２７ 讨论………………………………………………３１ 第四节临床标本沙眼衣原体ｏｍｐＡ基因序列分析 材料和方法…………………………………………３３ 结果………………………………………………３３ 讨论………………………………………………３５ 第一部分小结………………………………………．３６ 参考文献…………………………………………．．３６ 第二部分沙眼衣原体高分辨率溶解曲线基因分型方法的建立 前言舌………………………………………………３９ 材料和方法…………………………………………４２ 结果………………………………………………４９ 讨论………………………………………………５６ 日Ｕ舌……………………… 日Ｕ 参考文献…………………………………………．．５９ 第三部分男男性行为人群中沙眼衣原体的分子流行病学研究 前言………………………………………………６２ 第一节深圳市男男性行为人群沙眼衣原体感染率调查 研究对象和方法……………………………………．．６４ 结果……………………．………………………．．６７ 讨论………………………………………………７０ 第二节深圳市男男性行为人群沙眼衣原体感的分子流行病学调查 研究对象………………．．……………………．…．．７２ 材料和方法………………．……．．…………………７２ 结果………………………………………………７７ 讨论……．．………………………………………．８０ 参考文献………………………………．…………．８３ 全文总结………………………………………………８７ 论文相关综述…………………………………………．．８８ 英文论著１………………………………………………９６ 英文论著２……………………………………………．．１ １４ 英文论著３……………………………………………．．１２２ 在读期间发表文章和参加学术活动…………………………．．１２８ 致谢…………………………………………………．１２９ ＨＵ吾 ＣｏＮＴＥＮＴＳ Ａｂｂｒｅｖｉａｆｉｏｎｓ．．．．．．．…．．．…．．．．．．…．．．．．．．．．．．……．．．．…．．．……．…．．１ Ａｂｓｔｒａｃｔ ｉｎ Ａｂｓｔｒａｃｔ ｉｎ  Ｃｈｉｎｅｓｅ．…．．．．…．．．．…．…．…．．．．．．．．．……．．．．………．．．．…：！ Ｅｎｇｌｉｓｈ……………………………………………………．５ ＳＥＣＴＩＯＮｌ．ＯｍｐＡ Ｇｅｎｅ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ Ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ｏｆ Ｔａｒｇｅｔ Ｖａｒｉａｂｌｅ Ｓｅｇｍｅｎｔ ｆｏｒ Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ｉｎｔｒｏｄｕｃｔｉｏｎ……………………………．…………………………．９ Ｃｈａｒｐｔｅｒｌ．Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｏｍｐＡ ｇｅｎｅ  ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ  ｏｆ Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ ｄｏｗｎｌｏａｄｅｄ ｆｒｏｍ Ｇｅｎｂａｎｃｋ Ｍａｔｅｒｉａｌｓ ａｎｄ Ｍｅｔｈｏｄｓ………………………………………………．．１０ Ｒｅｓｕｌｔｓ……………………………………………………．……．．１１ Ｄｉｓｃｕｓｓｉｏｎ…………………………………………………………１６ Ｃｈａｒｐｔｅｒ２．Ｒｅｃｏｖｅｒｙ，ｃｕｌｔｕｒｅ  ａｎｄ  ｃｏｎｆｉｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ  ｆｉｆｔｅｅｎ  ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ  ｓｔｒａｉｎｓ  ｏｆ Ｃｈｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ Ｍａｔｅｒｉａｌｓ ａｎｄ Ｍｅｔｈｏｄｓ………………………………………………．１７ Ｒｅｓｕｌｔｓ……………………………………………………………２１ Ｄｉｓｃｕｓｓｉｏｎｓ……………………………………………