用于病毒高通量测序样品前处理及核酸扩增方案概述.pdfVIP

ChineseJournalof Medicine Veterinary 中国兽医杂志2016年(第52卷)第12期115 用于病毒高通量测序样品前处理及 核酸扩增方案概述 杨德全，鞠厚斌，刘 健，葛菲菲，李 鑫，王 建，杨显超，邓 波，葛 杰，周锦萍 (上海市动物疫病预防控制中心，上海阂行201103) 中图分类号：$855．3 文献标志码：B 随着测序技术水平的改进，测序通量的不断提 低宿主细胞和其他微生物基因的干扰并提高病毒 高，高通量测序技术得到迅猛的发展与普及，其在 核酸的丰度是鉴别病毒的重要前提，分离、扩增、获 病毒学领域的应用也越来越广泛。通常，有效的降 取目的基因的序列则是鉴别病毒的关键。然而，临 床上获得的样品中病毒含量一般较低，从少量高度 复杂的临床样品中发现目的序列如同“大海捞针”， 收稿日期：2016—05-03 因此，如何特异性的放大样品中的病毒含量显得至 基金项目：上海市市级农口系统青年人才成长计划项目[沪农 青字(2015)第2—6号] 关重要。本文就高通量测序技术中一些常用的从 作者简介：杨德全(1983一)，男，兽医师，硕士，主要从事动物病 未经培养的原始样品中获取病毒核酸序列的技术 毒病防控工作，E—mail：dequan_yang@126．coin 方法作一综述，以期使科研工作者更好的掌握高通 通讯作者：周锦萍，E—mail：shzjpvet@163．eonl 量测序技术在病毒学中的应用。 彬i戡芊彤f如}如f如}战}出于出币出币也乔出奇出奋彬夺出币也币也彳出尔出f也币出f出f出带!墒也带场战f也秘‰出f出苷出不出币出尔彬乖出譬彤不出币出不出币出苷出币出不出币出币出夺 检测提出的推断相吻合，[9‘1叫至于动物源性蛋白质 8讨论 过敏原的确切成分，还有待开展进一步的深入研究 有关大熊猫慢性营养不良综合征的发病原因， 确定。 国内外已开展过部分探索，但至今也未明确真正的 参考文献： 原因。伦敦动物园曾通过免疫学方法分析后认为， [1]张金国．大熊猫常见疾病的防治概况[c]．成都国际大熊猫保 该病的发生与食物中的卵清蛋白高度相关伊10J。张 护学术研讨会论文集，成都：四川科技出版社，1994： 金国等(1998)报道，该病病因与低L综合征相359-366． [2]张金国，张成林．大熊猫营养不良研究[c]．成都国际大熊猫 关心J。余建秋等(1998)报道，患该病大熊猫除表现 为低蛋白血症外，最明显的表现为毛发中Cu、zn、 保护学术研讨会论文集，成都：四川科技出版社，1998： 221-224． Mn等微量元素含量极显著低于健康个体旧J。张成 [3]余建秋，叶智勇，李光汉．大熊猫慢性胃肠炎研究[c]．成都国 林等(2014)认为，消化吸收障碍是引发大熊猫发生 际大熊猫保护学术研讨会论文集，成都：四川科技出版社， 该病病因∞J。而笔者通过采集患病大熊猫血液、粪 1998：228-233． L．Janssen， 便和结肠黏