小麦TaPhyB3基因蛋白结构的预测和染色体倍数关系与编码序列的初步分析.pdfVIP

2013 年26 卷2 期 a串帚农.:11:.学 il VoI. 26 No.2 Southwest China Joumal of Agricultural Sciences 399 文章编号:1∞1 -4829(2013)02 -0399 -07 小麦 TαPhyB3 基因蛋白结构的预测和 染色体倍数关系与编码序列的初步分析 李壮1 ，黄玉碧2 (1.四川农业大学农学院作物遗传育种系，四川温江 611130;2. 四川农业大学玉米研究所，四川温江 611130) 摘 要:从小麦品种中国春中克隆了 TaPhyB 在染色体4D 上的 cDNA 的全长编码序列，所得序列定位于4D 染色体长臂上，被命名 为 TaPhyB3。通过中国春 lD4D-6 D BAC 文库的筛选，设计引物亚克隆得到光敏色素基因 B 的基因序列，其含有4 个外显子和3 个内含子。通过生物信息学软件的预测，该基因编码蛋白的功能结构域有6 个; DAF DOMAIN ,PHYTOCHROME REGION , PAS-A DOMAIN ,PAS-B DOMAIN , HISTIDINE KINASE RELATED DOMAIN 1 和 HIETIDINE KINASE RELATED DOMAIN 2。编码序列与染 色体倍数关系的分析结果表明 TaPhyB3 基因的表达并不随染色体组的加倍而出现相应增长的趋势，推测在小麦中存在 TaPhyB3 的表达的调控与平衡问题。 关键词:小麦;蛋白结构;染色体;编码序列 中图分类号;Q559 文献标识码:A Prediction Protein Structure and Relationship between Chromosome Ploidy and Code Sequence of TaPhyB3 in Wheat U Zhuang 1 , HUANG Yu-bi2 (1. Institute of Crop Genetic Breeding , Agricultural College ,Sichuan Wenjiang 611130 ,China; 2. M副zeR自由rch Institute , Sichuan Agri- cultural University , Sichuan Wenjiang 611130 ,China) Abstract;币le 且I11-length cDNA 配quen四 of PhyB w.剧c10ned from the wheat cultivar Chinese Spring. 四is gene is located on chromosome 4D 皿d desi伊ed TaPhyB3. By screening lD4D-6D BAC Iibrary of Chinese Spring , desiguing primers and sub c1one , phyt∞hrome B gene S吨uence w田 obtained ， which included 4 exons and 3 in田ns. 四is gene encoding protein included 6 functional domains: DAF DOMAIN , PHYTOCHROME REGION , PAS-A DOMAIN , PAS-B DOMAIN , HISTIDINE KINASE RELATED DOMAIN 1 和 HIETIDINE KINASE RELATED DOMAIN 2 , res严ctively ， which predicted by bio-information 50世ware. Relationship between coding 配quen