缓步动物条形码及7种缓步动物系统发育研究.pdfVIP

安徽农学通报 ，AnhuiAgri．Sci．Bul1．2011，17(09) 45 缓步动物条形码及 7种缓步动物系统发育研究 王 广 明 (陕西师范大学生命科学学院，陕西西安 710062) 摘 要：缓步动物属于微小水生无脊椎动物，以隐生现象著称。该实验对4种缓步动物 l1个个体的COI基因序列进 行提取测定和分析，并与GenBank中下载的6种缓步动物 19条COI基因序列进行比对分析，用贝叶斯法(BI)构建 系统发育树，研究了共计7种缓步动物30个个体之间的系统发育关系。研究发现，缓步动物在DNA分子层面的分类 与形态学分类结果基本一致，表明COI基因可用于研究缓步动物系统分类及系统发育方面的问题。 关键词 ：缓步动物 ；COI基 因；系统发育 中图分类号 Q954 文献标识码 A 文章编号 1007—7731(2011)09—45一O3 A PrimaryStudyonBarcodingandPhylogenyof7SpeciesofTardigrades WangGuangming (CollegeofLifeSciences，ShaanxiNormalUniversity，Xi’an710062，China) Abstract：Tardigradesarehydrophytic，mierometazoaninvertebrate．TheDNA barcodingoffourspeciesoftardigradeswas studied．Atotalof30CoIgenesequencesofsevenspecies，includingXsequencesdownloadedfrom GenBankdatabase， wereusedtobuildphylogenetictreeusingMrBayes(BI)methods．TheresultsindicatedthatDNAtaxonomyisconsistent withmorphologicaltxaonomyinTardigrada．Thephylogenetierelationshipsandclassificationresearchoftardigradescanbe wellresolvedbyCOIgenesequences． Keywords：Tardigrade；COIgene；Phylogeny DNA条形码技术是对一段标准 的 目的基 因DNA序 火地塘等地的海拔 800～1600m处 ，取石头或树干上 的苔 列作为工具进行分析而开展物种鉴定 的技术… 。在 目前 藓(10em×10cm)置于纸袋中编号保存备用。 的DNA条形码工作中常用的基因片段有 18SrRNA和 16S 表 1 采样信息 rRNA、12SrRNA基因及COI基 因，和rRNA基因相 比，CO I基 因保守性好且有一定的变异 ，基因序列 的长度合适 ， 可用通用引物扩增 。综合基因序列的进化速率和长度 ，最 终选定COI基因作为条形码来研究 。缓步动物 (Tardi— grade)俗名水熊，是一类体型微小的水生无脊椎动物 ，体 长为250～500p,m，在系统分类上属于一个独立的门，缓步 动物能在极端恶劣的环境条件下存活，以隐生现象著称。 缓步动物 的形态学分类鉴定主要依据其表皮、腿部、爪 、口 器复合物、吸咽、头部附属物、生殖结构以及卵等 。对采 集到的4种缓步动物单个个体的COI基 因序列进行提取 测定和分析 ，并与 GenBank中下载的6种缓步动物 19条 COI基 因序列进行 比对分析 ，计算遗传距离 ，贝叶斯法 (BI)构建系统发育树 ，研究其分子进化和变异情况 ，探究 缓步动物在 DNA分子层面的分类和形态学分类结果的关 系，以及基于COI基因的DNA条形编码用于缓步动物分 类的可行性 。 1 材料和方法 1．2 实验方法 1．1 实验材料 缓步动物采集于秦岭的终南山、旬阳坝 、 1．2．1 分离 将苔藓放在培养皿中，加清