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厦门大学生命科学学院
注意事项及填写说明(送样前必读)
如果阅读完以下说明还不知道该如何准备样品,请到A113咨询;TripleTOF 5600和5600+ 只
送样时需一起提交申请单;样品不能含有SDS、TritonX-100、NP-40、PEG、Tween-20、甘油会抑制如需所用
所送样品所属的蛋白库要在能有哪些信誉好的足球投注网站到,或者
胶样品:
要求
可以保存单个?L;
制样注意事项
样品尽可能跑在一条泳道内,如果样品体积太大无法跑在一条泳道中最好进行浓缩处理,以提高样品最少 cm。建议如非必要胶的浓度最好不要 10%,影响
不建议银染;或银染时,敏化不加戊二醛,染色时不加甲醛,显色时才加(戊二醛会造成蛋白交联,影响酶解)
考染样品控制染色时间,不宜染色太深(看得到条带即可),然后用脱色液脱色然后用把即可(脱色所用
在通风橱切胶,切胶时请带上口罩,女生绑好头发,采用干净的手套和一次性刀片;
为减少样品损失,切胶时请务必去掉非目的条带部分,尽量减少样品体积,建议每管样品胶体积小于300ul;
切胶时请尽量避免条带间的交叉污染;把胶切成约2 mm X 2 mm尺寸的小块放于进口1.5 mL 离心管内(每管 uL),然后用超纯水(ddw)洗三遍以上,随后用乙腈脱色液[40% 乙腈(ACN),50 mM碳酸氢铵(ABC)in H2O]脱至无色,样品最后保存在乙腈脱色液中。
请务必根据marker估计每个样品的蛋白量(多少ug或ng),否则不受理该申请单(无法进行酶解处理);
IP样品:
样品以溶液方式送样(必须注明样品体积uL):A.如果从细胞裂解液中IP,裂解以mL PBS洗3次以上,置于min/次(去除样品中残留的SDS,TritonX-100,NP-40,Tween-20,甘油等),把beads转移到一个新的EP管中,PBS洗一遍,底用小针扎一个洞直径beads直径),用另一个EP管底下,轻微离心去除残余PBS,现配现用样品加入温度不能超过C,温度过高引起修饰影响鉴定效果于用B. 如果溶液样品不是用8M尿素溶解,请提供IP的详细操作步骤TritonX-100,Tween-20,NP-40,CHAPS,PEG,证明
样品以粉末方式送样:IP洗脱后的样品体积大,蛋白量较多(大于50 ug),可以用TCA(三氯乙酸样品注明样品在用前溶液成分,是否含有TritonX-100,Tween-20,NP-40,CHAPS,PEG,)
以胶样品送样:IP后跑胶后根据条带强弱分成若干组分切下送样分析(胶样品请参考注意事项4);
全细胞裂解液/组织提取液:(最好用8M尿素裂解细胞,刮下后冰上超声超停,探头温度下降后继续超声不可长时间超声温度超过C,引起蛋白液氮研磨后用。
溶液样品需注明溶剂成
蛋白量尽量估计准确;
翻译后(磷酸化)修饰鉴定:
磷酸化修饰鉴定请注明:A. S+T磷酸化,Y磷酸化或者S+T+Y磷酸化; B.如果只鉴定某个蛋白磷酸化,请注明所要鉴定磷酸化蛋白的基因名字和accession number;
简单样品(胶样品,IP样品等)请提供尽量多的目的蛋白( 1 ug);
复杂样品(全细胞裂解液,组织提取液等),请提供至少5mg蛋白;
肽指纹图谱(蛋白测序):
要求样品纯度高,样品量2ug;
打肽指纹图谱,请提供序列,同时发电子版申请单至wuyy@或xiechch@。
复杂样品定量(label-free iTRAQ标记定量或者双甲基标记定量)浓度后,样品?g送测,剩余样品请自行保存。
按照
带有*号标记的项必须填写。
物种来源:填写所送样品所属物种的学名,例如:所送样品是人源p62,就填写Homo sapiens;在小鼠细胞中转染人源p62,IP p62想要相互作用蛋白时,填写 musculus。
使用中文,超过字母,上的样品名称必须与样品管上一致,
单位名称:校内单位请填写各,校外填写的全称。
8M尿素:尿素溶解在0.1 M pH8.0 Tris缓冲液中
发文章时,如有用到本中心所给的数据,请务必在文中致谢厦门大学生命科学学院分析测试中心(Analysis and Testing Center,School of Life Sciences, Xiamen University),并通知我们,以便我们统计和评估工作成果,进而不断提高服务水平。
所有样品必须注明样品中的蛋白量(多少mg,ug或者ng)
附Commassie法
Commassie法优点是:
1.灵敏度高,据估计比Lowry法约高四倍,其最低蛋白质检测量可达1ug。这是因为蛋白质与染料结合后产生的颜色变化很大,蛋白质-染料复合物有更高的消光系数,因而光吸收值随蛋白质浓度的变化比Lowry法要大的多。
2.测定快速、简便,只需加一种试剂。
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