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pmCherry-C1-Argonaute1重组质粒的构建研究

pmCherry-C1-Argonaute1重组质粒的构建研究   应激蛋白Argonaute1是一种多功能蛋白,参与RNA干扰及应激颗粒(SGs)、加工体(PBs)形成等多种细胞生物学过程。pmCherry-C1是一种可以编码红色荧光蛋白的真核表达载体。2015年9~11月,本研究通过基因工程技术将Argonaute1基因片段连接至pmCherry-C1载体,构建pmCherry-C1-Argonaute1重组质粒,旨在为深入研究Argonaute1蛋白的细胞生物学功能提供便利工具。   1材料与方法   1.1材料质粒、菌株及细胞:pmCherry-C1载体由JohanPerane博士馈赠,感受态大肠杆菌Trans1购自天津科仪嘉欣科技有限公司,HeLa细胞来自本实验室。酶类及主要生化试剂:限制性内切酶EcoRⅠ、BamHⅠ及T4DNA连接酶均购自ThermoFisherScientific公司,Taq酶购自北京鼎国昌盛生物技术公司,T/A载体(pEASY-T1)购自北京全式金生物技术有限公司,B型小量DNA快速回收试剂盒购自北京博大泰克生物基因技术有限公司,质粒快速提取试剂盒购自北京索来宝科技有限公司,去内毒素质粒提取试剂盒购自Promega公司,Lipofectamine2000购自Invitrogen公司,BCA蛋白检测试剂盒购自Pierce公司,LumiGLo化学发光底物购于KPL公司。抗体:兔抗人Argonaute1单克隆抗体购自CST公司,鼠抗人G3BP单克隆抗体和兔抗人DCP1alpha;抗体购自abcam公司,鼠抗人樱桃红蛋白(Cherry)单克隆抗体购自MBL公司,蓝色荧光(AlexaFluor350)标记的驴抗鼠荧光二抗和绿色荧光(AlexaFluor488)标记的驴抗兔荧光二抗购自Invitrogen公司,辣根过氧化物酶标记的抗鼠和抗兔IgG二抗购自KPL公司。引物合成及基因测序由北京天一辉远公司完成。   1.2pmCherry-C1-Argonaute1重组质粒构建   1.2.1Argonaute1蛋白目的片段获取提取HeLa细胞的总RNA,以TGGACCAAAAGGGGCAGCACTGGTGCCC序列进行Argonaute1的cDNA扩增;根据CDS序列(NM012199.2)设计含有EcoRⅠ和BamHⅠ限制性内切酶位点的引物序列,即F:5#39;-CCGGAATTCCATGGAAGCGGGACCCTCGGGAG-3#39;;R:5#39;-CGCGGATCCTCAAGCGAAGTACATGGTGCGCA-3#39;;以反转录的Argonaute1cDNA为模板,扩增PCR目的片段,条件为95℃预变性5min,95℃30s、65℃45s、72℃3min,共15个循环,每次循环降低1℃,再以50℃进行20个循环,72℃延伸10min;将PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳鉴定,紫外灯下切割含有目的条带的凝胶块,利用凝胶回收试剂盒回收目的片段,并将目的片段与pEASY-T1(T/A载体)于25℃连接15min。连接产物转化Tran1-T1感受态细胞,置于含有氨苄/卡那霉素的LB平板上筛选克隆。挑取阳性克隆,摇菌扩增并提取质粒。以EcoRⅠ和BamHⅠ进行双酶切,凝胶回收试剂盒回收并纯化目的片段。   1.2.2线性pmCherry-C1质粒载体获取以质粒快速小提试剂盒提取pmCherry-C1质粒,进行EcoRⅠ和BamHⅠ双酶切,完整切下呈线性的pmCherry-C1质粒载体,以1%琼脂糖电泳分离,再以凝胶回收试剂盒回收pmCherry-C1线性载体(约4700bp)。在T4DNA连接酶作用下,将线性pmCherry-C1质粒载体与具有相同黏性末端的Argonaute1功能片段于22℃下连接并过夜。连接产物转化感受态细菌大肠杆菌Trans1,在含有卡那霉素的LB平板上筛选克隆。挑取阳性克隆,摇菌扩增并提取重组质粒。   1.3pmCherry-C1-Argonaute1重组质粒鉴定   1.3.1酶切及基因测序采用EcoRⅠ和BamHⅠ对重组质粒pmCherry-C1-Argonaute1进行单、双酶切鉴定,并以1%琼脂糖凝胶电泳验证片段大小;同时对重组质粒进行基因测序鉴定。   1.3.2融合蛋白检测采用Westernblotting法。以预冷的1times;NP-40裂解液裂解细胞,超声破碎细胞后4℃、12000r/min离心10min,取上清获取全细胞裂解液,以BCA蛋白测定试剂盒测定总蛋白浓度。裂解液中加入SDS上样缓冲液(pH6.8的50mmol/LTris-Cl、2%SDS、0.1%溴酚蓝、10%甘油、2.5%beta

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