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简明蛋白质复习题
名词解释 蛋白质组学:以蛋白质组为研究对象,从整体水平上分析一个有机体、细胞或组织的蛋白质组成及其活动规律的科学。蛋白质组学是研究与基因对应的蛋白质组的学科,蛋白质组一词,源于蛋白质与 基因组两个词的杂合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。 噬菌体展示:将各种多肽或蛋白质以融合蛋白的形式表达并展示在噬菌体表面,同时将其遗传密码包含于噬菌体内部,这使得蛋白质的功能与其基因密码有机的连结在一起。 表面等离子共振:目标蛋白通过氨基共价偶联在金膜表面制成生物传感器,当一束偏振光照射到传感芯片的金膜时会引起金属中的电子共振,而导致反射光会在一定角度内大大减弱,其中反射光完全消失的角度称为共振角。将待测蛋白质(肽)溶液流过该固相载体,在金膜表面固定有相互作用的蛋白质后会改变冲击光的共振角,这是由于金膜表面蛋白质含量的增加,导致折射率改变的结果,而且变化值与蛋白浓度正相关。 蛋白质芯片:又称蛋白质阵列,是指以蛋白质分子作为配基,将其有序地固定在固相载体的表面形成微阵列;用标记了荧光的蛋白质或其他它分子与之作用,洗去未结合的成分,经荧光扫描等检测方式测定芯片上各点的荧光强度,来分析蛋白之间或蛋白与其它分子之间的相互作用关系。 亲和色谱:根据蛋白质或者多肽与专一性配基的亲和力来进行分离。 蛋白质组:基因组表达的全部蛋白 酵母双杂交:将待研究的两种蛋白质的基因分别克隆到酵母表达质粒的转录激活因子(如GAL4等)的DNA结合结构域基因和GAL4激活结构域基因,构建成融合表达载体,从表达产物分析两种蛋白质相互作用的系统。 X射线晶体衍射:当X射线经过蛋白质晶体时会以一种可预测的方式被散射或衍射。X射线在遇到电子时发生衍射,因此衍射的特征依赖于出现在每个原子中电子的数量和原子的空间排列。衍射形成的斑点图案可以用于构建分子的电子云三维图。蛋白质的结构模型建立在电子云三维图上。 核磁共振:核磁矩不为零的核,在外磁场的作用下,核自旋能级发生塞曼分裂,共振吸收某一特定频率的射频(RF)辐射,这一物理过程就是核磁共振。 双分子荧光互补:由 Hu 等在 2002 年最先报道的一种直观、快速地判断目标蛋白在活细胞中的定位和相互作用的新技术。该技术巧妙地将荧光蛋白分子的两个互补片段分别与目标蛋白融合表达,如果荧光蛋白活性恢复则表明两目标蛋白发生了相互作用。 填空 蛋白质组学研究的范畴为 结构 功能 比较__和 表达 Uniprot数据库 Swiss-Prot、 TrEMBL 和 PIR-PSD 是三大数据库的整合体。 第一个关于蛋白质组学的服务器是 Swiss-Prot 建于Geneva大学,由瑞士生物信息学研究所(SIB)与欧洲生物信息学研究所(EBI)共同协作维护。 目前蛋白质组学研究中关于蛋白质分离的两大支撑技术是 非选择性分离_和 选择性分离 。 双向电泳分离蛋白质的基本原理是第一向根据蛋白质__等电点进行分离,第二向根据蛋白质 相对分子质量 分离。 蛋白质常见的修饰方式有 磷酸化 和 糖基化 泛素化三类。 蛋白质芯片通常可分为分析蛋白质芯和 功能蛋白质芯片 两大类 。 解析蛋白质结构的实验方法主要是 NMR 和 X射线晶体衍射法 简答题 试述蛋白质组学当中蛋白质定量的方法。 双向电泳;DIGE:不同的蛋白样品都在赖氨酸侧链上标记上丙基-Cy3和甲基-Cy5。蛋白样品在电泳分离前就混合,电泳完毕后用照相机或荧光扫描获得2组图像,然后叠加; ICAT; 体内同位素标记:在培养细胞或组织的过程中使用含有重氮、重氢或重碳的培养基,然后收集蛋白做比较;质量编码丰度标签:使用特定的化学加和物; 双向电泳的基本原理是什么? 第一向根据蛋白质的等电点进行分离;第二向根据蛋白质的相对分子质量分离。HYPERLINK /view/81786.htm等电聚焦电泳和SDS的组合,即先进行等电聚焦电泳,然后再进行SDS(按照分子大小),经染色得到的电泳图是个二维分布的蛋白质图。 质谱技术在蛋白质组研究当中有哪些应用? 生物质谱技术1.电喷雾质谱技术(ESIMS)电喷雾质谱技术 ;基质辅助激光解吸附质谱技术(MOLDI)还广泛的应用于肽指纹图谱测定及氨基酸序列测定。 质谱分析所得肽断与多肽蛋白数据库中蛋白质的理论肽断进行比较,判断出所测蛋白是已知还是未知 (1)分析完整肽离子 计算完整肽段的质量,还广泛的应用于肽指纹图谱测定及氨基酸序列测定。根据各肽段的质量与相关数据库鉴定蛋白质。 (2)分析碎片离子 根据碎片离子推断氨基酸序列组成,在结合相关数据库查询。 质谱法是一强有力的分析技术。它可用于未知化合物的鉴定、定量分析、分子结
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