实验 一、A提取及检测.ppt

  1. 1、本文档共11页,可阅读全部内容。
  2. 2、有哪些信誉好的足球投注网站(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
  3. 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  4. 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
实验 一、RNA提取及检测 一、实验目的 掌握植物RNA RNA提取及检测方法 二、实验试剂及材料 水稻叶片、液氮、Trizol试剂、氯仿、异丙醇、DEPC水 三、实验器材 恒温水浴锅、PCR仪、台式低温离心机、移液枪、研钵、紫外分光光度计,一次性手套。 四、实验步骤 采用Trizol法提取RNA(50-100mg组织∕ml trizol),以加1ml Trizol为例,操作流程如下: (1) 研钵加液氮数次至足够冷,加入样品,研磨至粉末。加入Trizol(每100mg组织加1ml的Trizol),充分研磨,放在室温下解冻。 (2) 除不溶性物质:2~8oC下12000g离心10min,不溶性物质沉淀,将RNA的上清移入1.5 ml离心管中。 (3)相分离:在15~30℃下放置5min,使核蛋白复合物完全解离。加0.2ml氯仿,剧烈振荡15 sec,室温下温浴2~3min。2~8℃下,≤12000g离心15min,RNA全部溶解于上层水相中,把水相移入另一1.5ml离心管中。 (4) 氯仿再次去杂:加0.5ml氯仿,剧烈振荡15sec,室温下温浴2~3min;2~8℃下,≤12000g离心15min,把水相转入1.5ml离心管中。 (5) RNA沉积:加入0.5ml异丙醇,15~30℃温浴10min;2-8℃下,≤12000g离心10min,RNA沉积在离心管的底部及侧壁。 (6)清洗RNA:加入1ml 75%乙醇,2~8℃下≤7500g离心5min,小心将上清液倒掉。 (7)再清洗:加入1ml 75%乙醇,2~8℃下,≤7500g离心5min,小心将上清液倒掉。 (8)RNA的溶解:将离心管倒扣在吸水纸上5~10min,每管加30μl的DEPC水,可在55~60℃下助溶10min。 (9)RNA浓度:用DEPC水稀释100倍,用紫外分光光度计 测定OD值(260nm、280nm 230nm),估算RNA浓度。-70 ℃保存。 总RNA定量方法 ? RNA在260nm波长处有最大吸收峰。OD值为1相当于大约40μg/ml的单链RNA。如用1cm光径,用 ddH2O稀释DNA样品n倍并以ddH2O为空白对照,根据此时读出的OD260值即可计算出样品稀释前的浓度: RNA(mg/ml)=40×OD260读数×稀释倍数(n)/1000 ? RNA浓度检测过程 (1)取少量待测RNA样品,用DEPC 水稀释100倍。 (2)用DEPC 水做空白,在260 nm、280 nm、230 nm处调节紫外分光光度计的读数至零。 (3)加入待测RNA样品在三个波长处读取OD值。 RNA纯品的OD260/OD280的比值为2.0,故根据OD260/OD280的比值可以估计RNA的纯度。若比值较低,说明有残余蛋白质存在;比值太高,则提示RNA有降解。 OD260/OD230比值应≥ 2.0,若比值较低说明盐分过高。 电泳检测RNA质量: (1)配制1.2%的琼脂糖凝胶(20mL) 称取琼脂糖0.24 g,加DEPC处理的ddH2O 12.04 mL,5×RNA 电泳缓冲液4 mL,电炉加热融化琼脂糖,冷却至55°C,加入甲醛1.96 mL,冷却后倒胶。 (2)RNA电泳 取去离子甲酰胺10 μL,甲醛1.5 μL,10× RNA Buffer 2 μL,RNA (2~4 μg, 10 μL)混合液,65°C加热15min,迅速在冰浴中冷却片刻,然后加入3 μL RNA 加样缓冲液和0.5 μL EB,上样电泳。电泳Buffer 为1× RNA buffer。 (2)RNA电泳结果判别质量: 出现的电泳条带有两条,是两条最大的核糖体RNA(rRNA)分子,即18S 和28S rRNA,较小的RNA也很丰富但看不到,因为太小,跑出了凝胶的边界。多数细胞中的信使RNA(mRNA)经EB染色后不足以形成可见的带。只要18S 和28SrRNA带亮,且28S rRNA大约为18S rRNA 的两倍,说明提取的RNA没有发生降解,纯度好。 五、总RNA提取常见问题分析 RNA降解 1、外源RNA酶的污染:试剂,器械及实验环境中的RNA酶进入实验系统。 2、内源RNA酶的污染:抑制剂失效或者用量不够,实验样品过多;匀浆时温度过高。 3、外源性污染也可以排除,那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,一定要使裂解液能覆盖住细胞。在液氮条件下将组织研碎,并且匀浆时使用更多裂解液。样品取材后应立即置于液氮中速冻,然后移至-70℃冰箱保存。样品决不能未经液氮速冻而直接保存于-70℃冰箱中。样品在与裂解液充分接触前决不能出现融化,所以研磨用具必须预冷。 OD260/OD280比值偏低 1. 蛋白

文档评论(0)

jiqingyong12 + 关注
实名认证
内容提供者

该用户很懒,什么也没介绍

1亿VIP精品文档

相关文档