第四章RNA的转录概述.pptVIP

第三步：释放出的内元可继续进行转酯反应 而形成环状 4Nt + 395Nt linear intron （L19） 内元自身能形成特定的二级结构，产生适于拼接反应的构象和活性位点,在G的参与下完成拼接反应 活性位点 in vitro pre-35s rRNA GMP32 ~ 414Nt intron GTPα32 Lose 19 Nt + 399Nt circle intron 4Nt + 395Nt linear intron GMP32 ~ 15Nt L19 L19 as polymerase of poly(C) 3‘-G-OH GGGAGG pCCCCC-OH GGGAGG pCCCCC-OH 3‘-G-OH 3‘-G C-OH GGGAGG pCCCCCC- OH 3‘-G GGGAGG C-OH 3‘G-OH GGGAGG HO-CCCCp HO-CCCCCCp 第Ⅱ类内元的拼接 拼接点序列 5’----exon----- GUGCG---------B.S----Py AU ----exon---3’ 供点 受点 ----Py Pu Py Py U A Py--- 100% 7核苷酸的保守序列 （Branch Site ） 3’ 拼接点上游 6bp ~ 12bp 处 Branch Site 的两侧存在一些短的序列， 与其上游10-50Nt处互成 IR,形成茎环结构(但A不包含在 IR序列内, 从而被排除成芽状突起） 5’--GUGCG--------------------PyPuPyPyUAPy-----PyAU—3’ Intron IR IR 5’ G AU 3’ A 拼接机制 Intron IR IR A 5’ G AU 3’ Exon 1 Exon2 G A intron PyAU Matural RNA 转酯攻击位点 intron OH AU 2‘ A 3‘ G Cowboy’s lasso “Lariat” intron 不连续转录和反式拼接 反式拼接： 发生在两个RNA分子之间的拼接（trans-spling） 1982 Vander Ploeg等人研究锥虫的可变表面糖蛋白基因时发现：在其mRNA的 5’端有35个 bases 是其基因中所没有的； 随后发现，锥虫的全部mRNA都含有这个 35bases 序列； 这个 35bases 序列称其为前导序列 前导序列 由位于基因组其它区域的连续重复序列转录而来； 200 copies左右； 每个重复单位的 3’端还有100base 的一段序列（内元） 因此，一种完整 mRNA 的前导序列及特异基因编码的 mRNA序列部分的转录是不连续的。 拼接机制 35base SL 4.6.3 Rho因子的终止原理 ρ因子是六聚体，具有NTPase酶活性（只有RNA链长超过50时才具有）； ρ因子一般认为从RNA的5’端结合上去，也有学者认为存在特定的结合区域； ρ因子沿着转录出的RNA移动要比RNA聚合酶延DNA移动快。当RNA 聚合酶达到终止子时就暂停下来，那么在此位置ρ就会追上RNA聚合酶。 ρ因子可通过与RNA聚合酶β 亚基的直接作用，使RNA聚合酶从转录复合体脱落下来； 当然发卡结构后的序列也要求有比较低的接合能力，如果低到一个更低的数值，该终止子也就成为不依赖 ρ因子的终止子了。 4.6.3 无义突变的极性效应 在翻译比较旺盛时，原核细胞转录和翻译同时进行， 由于核糖体挡道，ρ因子很难追上RNA聚合酶。因此在一个操纵子中，前一个基因内部的无义突变可使ρ因子追上RNA聚合酶，使得后随基因表达受阻。 4.7 转录后处理 pre-RNA capping tailing splicing methylation Etc. mature RNA 4.7.1 帽子 真核生物的转录起始位点可以是pppA或者pppG，但真实的情况却总是N7甲基鸟苷酸打头，并且通过5’-5’磷酸二酯键与下一个核苷酸连接，why?； 真核生物通过一系列的反应在5’端加上了帽子，不同的真核生物有不同的帽子结构： Cap-0 　　m7GpppXpYp------- (单核真核) Cap-1 m7GpppXmpYp-------（高等真核） Cap-2 m7GpppXmpYmp