兔出血症病毒分鉴定vp60基因克隆及rt-pcr检测方法的建立.pdf

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兔出血症病毒分鉴定vp60基因克隆及rt-pcr检测方法的建立

四川农业大学硕士论文 中文摘要 兔出血症(Rabbit hemorrhagic 的兔的急性高度接触性传染病,给养兔业造成巨大的经济损失,为了在生产中防制该 病,有必要对毒株进行分离鉴定及其特性研究,以及建立一种灵敏、准确的检测方法. 本研究从兔病料中分离鉴定出了3株有不同血凝性的兔出血症病毒,分别命名为 为1:5,l:10,但琼扩实验及对流免疫电泳均能看到清晰的沉淀线,电镜负染可见大 量球形,核心密度不同、大小约30hm的病毒粒子. 是一个很保守片段.在遗传进化上,世界各地的RHDV毒株在核苷酸水平上趋向4个支 谱系,在氨基酸水平上趋向3个支谱系,谱系问没有明显的地理或时I闻特征, 别组成两支不同的谱系,以上结果对认识R皿y的变异趋势具有参考价值。利用软件分 析了分离毒株的分子量,疏水性、抗原性、表面可能性、密码子偏爱性和二级结构等 分子结构特征,并推测可能与其血凝性最相关的氨基酸位点为P2区的第304、305位, 及E区的第432位;其次是F区的第480、508位.该分析结论在国内外未见系统报道, 为RHDV的分子生物学增添了新的资料. 根据GenBank中的衣壳蛋白VP60基因内的保守序列,用Primer5.0设计出l对 i差tYT检测;该方法特异性强,重 并采用该RT-PCR方法对人工致死家兔体内的RHDV 的灵敏度高、特异性好的RT-PCR方法及其P,HDV抗原检测结果在国内未见报道· 本研究分离鉴定出有不同血凝性兔出症病毒株,并对其衣壳蛋白VP60基因进行了 分子生物学及其结构特征增添了新的资料,并为生产中RHDV的检测提供了科学依据和 一种灵敏、准确的检测方法. 关键词:兔出血症病毒;衣壳蛋白;VP60基因;序列分析;RT-PCR检测 Ⅱ 四川农业大学硕士论文 and VP60 Identificationthe of Protein Thelsohfionand CloningCapsid RT-PCR GeneofRHDVstrainsand DetectionforRHDV Tian Veterinary Lag(PreventiveMedicine) Directed byPro£WangHong-ning Abstract:.Rabbit iscausedRabbit hemorrhagicdisease(IbD),whichby hemorrhagic disease a and disease.andcall∞saloHnou$ Virus(R]田)V).israt蛔∞me,白taIcontagious in controlthe isolateand loss to economyrabbit自皿她To di鬻as岛itsn∞觑略ary id_a俯匆 the their asensitive virus蛐觚andstudy andaccuratedetec血喀md枷forRHDV. Inthis strainsofRHDVwereisolatedandidentifie

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