伪狂犬病病毒g基因的生物信息学分析.pdf

中文摘要 PCR检测出2头为阳性，并从中成功的分离到两株伪狂犬病病毒株，将其分别命名为 Ss株和SQ株。将所有的毒株连同四川农业大学动物生物技术中心保存Fa株、疫苗 院英东生物工程学院娄高明教授惠赠的北京株BJ株、广东株DG、湖北株Hs株共计 12株伪狂犬病病毒株，应用PER技术扩增得到了PRV完整的gD基因的片段12条。 回收PCR产物，成功连接转化到感受态细胞E．coliDH。中，并通过菌落PCR和酶切 鉴定正确后测序。 将所的12条序列连同GenBank中登录的9条gD基因全序列共21条基因序列， 使用生物软件对它们的基因序列的同源性、突变区域的定位、遗传进化关系、酶切位 点的差异、密码子偏爱性，氨基酸序列的同源性、蛋白质亲水性、抗原表位分析、二 级结构、三级结构预测等生物信息学的内容进行预测和分析。结果表明：PRV-gD基 位有个高变重复区，不同毒株基因均对GC极为偏爱。在遗传进化关系上将我国PRV 流行分为四川、华北、东南三个区域。毒株间基因内酶切位点、蛋白质亲水性、抗原 表位和蛋白质高级结构预测等内容的分析结果十分相似，说明PRV-gD基因具有很高 的保守性。该研究从病原、分子水平、生物信息等方面对PRV-gD基因进行了研究， 对于PRV的流行病学研究及诊断和防治具有重要意义。 关键词：伪狂犬病病毒gD基因PER序列分析生物信息学 ofPscudorabiesVirUS Bioinformatics gD analysis gene Xu inPreventive Veterinary Yanfeng(Major Sicience) Zhiwen DirectedProfessorGuoWanzhuandassociate Xu by professor Abstract Two abortuswasresulted virus detectedin14 gD—PCR pig’s ofpseudorabiesby pig’S abortuswhichwere fromseveral inSichuan up hogpen province picked large—scale between2004．6-2005．6．AndthenweIsolatedtwo virusstrainfrom pseudorabies thesetwo abortus arenamedSSand towhere pig’S successfully．They SQaccordingthey were are12 virus and Sichuan up．There pseudorabiesstrain，SS、SQFa(savedby picked Animal SA215、783strain、 AgricultureUniversity biotechnology