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石鲽遗传多样性及石鲽6与牙鲆旱杂交子一代的遗传学分析 石鲽遗传多样性及石鲽各与牙鲆早杂交 子一代的遗传学分析 摘要 对石鲽群体遗传多样性进行了分析;对石鲽及其它四种鲽形目鱼类养殖群体的遗 传结构进行了同工酶分析;采用PCR的方法对石鲽核糖体DNA(包括18SrDNA。 ITSl,5.8S rDN^的D1-D3区)及其假基因进行了克隆和分子 rDSA,ITS2,28S 进化分析;对石鲽及其它五种鲽形目鱼类的ITS2和28SrDNA的D卜D3区进行了 序列和分子系统学分析;对石鲽6与牙鲆早杂交子一代进行了同工酶、ISSR和 rDNA的遗传学分析。主要结果如下: 1、采用水平淀粉凝胶电泳技术对石鲽14种同工酶在8种组织中的表达进行 了分析,并在此基础上对石鲽三个野生群体的遗传多样性进行了研究,共记录了 种组织中均有表达,其它基因座位的表达表现出不同的组织特异性。石鲽QD群 体、WH群体和LZ群体的多态座位比例变化范围为:25.00%-29.17%;观察杂合 的遗传分化较小,基因流较大Nm=14.98。 2、采用水平淀粉凝胶电泳技术对石鲽及其它四种鲽形目鱼类养殖群体的遗 传结构进行了分析,结果表明,几种鲽形目鱼类养殖群体的多态座位比例的变化 (大菱鲆)一0.086(牙鲆);期望杂合度(伪)的变化范围为:0.000(大菱鲆) -0.090(牙鲆)。与已有野生群体的研究结果相比较,石鲽养殖群体的遗传多样 性尚未发生明显变化;大菱鲆和漠斑牙鲆养殖群体的遗传多样性发生了明显降 低;牙鲆养殖群体虽然群体杂合度没有明显变化,但发生了部分稀有等位基因的 丢失;半滑舌鳎养殖群体的多态座位比例发生了一定程度的降低。 3、利用ISSR技术对石鲽3个野生群体和1个养殖群体的遗传多样性进行了 石鲽遗传多样性及石鲽6与牙鲆旱杂交子一代的遗传学分析 分析,用筛选出的8个重复性好、多态性高的引物进行扩增分析.共得到183 个扩增位点,片段大小在200-3000bp之间,四个群体多态位点比例分别为:50.鼢 (YZ群体),养殖群体的遗传多样性低于野生群体。石鲽群体间的遗传距离较小, 表明石鲽群体间的遗传分化较小,不同群体间的遗传相似度较大。 rDNA,ITSl,5.8S 4、采用PcR的方法对石鲽核糖体DNA(包括18S rDNA,ITS2, 28S rDNA的D卜D3区)及其假基因进行了克隆和序列分析,并利用RT-PCR技术 对rDNA的表达进行了分析,发现石鲽基因组内不仅存在较大的rDNA多态性,还 存在大量的rDNA假基因序列。 rDNA,18S 石鲽基因组内存在三种主要类型的18S rDNA类型I的长度为1838 bp;18SrDNA类型II的长度为1823bp,与类型I相比有1个15bp的缺失,18S rDNA类型III的长度为1816 bp,与类型I相比除了上述的15bp的缺失外,还 rDNA类型I为石鲽预期的18SrDNA。 有1个7bp的缺失;详细的序列分析表明18S 采用PCR的方法对石鲽ITSl进行扩增得到片段大小不同的两条带(分别记为LFl 高的序列多态性,可以分为五组(组I,组II,组III,组IV和组V),组I—II 度(685-716bp)比组I—II的ITSl序列长度(765—776bp)短,但是组III-V ITSl (组I—II)相连接的18SrDNA为18SrDNA类型I;与SFlITSI(组III—V)相 rDNA为18SrDNA类型II和类型III。18SrDNA的表达分析表明, 连接的18S 18SrDNA类型I大量表达,没有检测到18SrDNA类型II和类型III的表达。 因此,18SrDNA类型I为功能基因,18SrDNA类型II和类型III为假基因;与
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