应用abemmm浮动电荷分子力场探讨gly(hlt;,2gt;o)lt;,ngt;(n=1-8)团簇的性质.pdfVIP

应用ABEEM／删浮动电荷分子力场探讨GLY(Ha0)。(nffil-8)团簇的性质 摘 要 甘氨酸(GLV)作为最简单的蛋白质结构单元和重要的生命营养物质，在生命体系中 扮演着十分重要的角色，因而探讨甘氨酸与水分子之间的相互作用具有非常重要的意 义。 本论文应用原子．键电负性均衡方法融合进浮动电荷分子力场(ABEEM／MM)I拘模型 和方法，编制和调试有关程序，构建了一个新的GLY-水势能函数，并将其应用到气相 进行各种性质的模拟并与从头算的计算结果进行比较，拟合一套理想的GLY-水势能模 从头计算相比同样得到了比较理想的结果。首先研究了GLY单体的几何构型，构型结 果与可获得的实验数据显示了很好的一致性；根据对GLY中氮原子和氧原子以及它们 的孤对电子的电荷分布的ABEEM／MM方法分析，可以解释水与作用点形成氢键的强 矩、ABEEM电荷分布、相互作用能以及氢键的协同效应等。这些研究结果与可获得的 实验数据和从头计算结果相比，都显示了很好的一致性。为了验证我们的GLY-水势能 模型的合理性以及参数的正确性和可转移性，我们研究了较大的GLY-水复合体系 这些研究结果与从头计算方法相比也显示了很好的一致性。 关键词：ABEEM／MM模型；甘氨酸；电荷分布；氢键作用；相互作用能 应用ABEEM／MM浮动电荷分子力场探讨GLYffl20)。(n_1．8)团簇的性质 Abstraot Asthe aminoacidandessential an simplest living important nutrition，glycine(GEl)plays rolein itisof interestto the interaction biologicalsystems．Sogreat studyglycine-water energies． We anew model and therelated present glycine—waterpotentialbycompilingdebugging basedontheatom—bond molecular programs electronegatiVityequalizationfluctuatingcharge force withtheABEEM-7Pwatermodel．The field(ABEEM／MM)，in conjunction potential was to clustersandto state of appliedstudyGlycine··water reproducegas··phase properties structuresandvibrational ofthe GLV(H20)n(n=1-8)．T1le frequencies weltexaminedthe usingB3LYP／6—311++G(d，p)method．T1leorder) with setwasusedtocalculatethe the theory6-311++G(3d，3p)basis bindingenergy,and set