环糊精对N苯甲氧羰基L天省略酸对映体手性识别的计算机模拟研究余江河.pdfVIP

药 　物 　生 　物 　技 　术 Phar maceutical Biot echnolo gy 　2008 ,15 (6) :453～457 453 β 环糊精对 N苯甲氧羰基L天冬氨酸对 映体手性识别的计算机模拟研究 1 2 2 ,3 1 4 余江河 ,张志强 ,何华 ,方惠生 , Chuong PhamHuy ( 1 中国药科大学 　生命科学与技术学院 , 南京 2 10009 ; 2 中国药科大学 　分析化学教研室 , 南京 2 10009 ; 3 药物质量与安全预警教育部重点实验室 ,南京 2 10009 ;4 L aboratory of Or ganic Chemi st ry ,Facult y of Pharmacy , U niver sit y of Pari s V ;4 avenue de l ’Ob servatoire ,75006 Pari s ,France) β 摘 　要 　应用 Dock 刚性和 Gold 柔性对接比较研究了 环糊精对 N苯甲氧羰基L天冬氨酸对映体的手性 识别 。模拟结果表明:分子柔性在手性识别中的作用不可忽视 ; Gold 对接的模拟结果能很好的和实验结果吻 β 合 ,复合物的结构特征也与 Connor s 和 Licht ent haler 等的观点一致 。因此基于 Gold 对接建立了 环糊精对 N 苯甲氧羰基L 天冬氨酸对映体的手性识别模型 ;对模型的结合能数据分析发现 ,氢键作用在分子识别中占据了 117 % ,可见对映体手性识别的主要驱动力是氢键作用 。 β 关键词 　Gold 刚性 ;Dock 柔性 ; 环糊精 ;手性识别 ;模拟 中图分类号 :R9 17 ;O64 1. 3 　　　文献标识码 :A 　　　文章编号 :100589 15 (2008) 　　对映体的手性差异通常会影响其在生物体内 有内部疏水 、两端 口亲水的锥状空腔的特殊结构 , 的生理和药理学活性[ 1 , 2 ] , 因而对映体的手性识别 其空腔内径约为0 . 65 nm ,高约为0 . 79 nm ,能与许 是生物学和药理学一个重要的研究课题 ,该类化合 多化合物通过氢键 , 范德华 , 疏水等非键相互作 物手性拆分和定量研究已经成为药物开发和临床 用[ 5 , 6 ] 形成主客体包合物 。 药学的重要组成部分[3 ] 。目前 ,手性物质拆分最常 对映体分子除了旋光性不同外 ,具有相同的物 用的方法是以环糊精及其衍生物作为流动相添加 理 、化学性质 。而环糊精由于其特殊的内部疏水空 [4 ] β 剂或固定相与 H PL C 或 CE 配合使用 。 环糊 腔结构及强手性环境使环糊精及其衍生物广泛用 (β ) ( ) 精 Cyclo dext rin 图 1 是由7 个 D吡喃葡萄 于对映体的手性识别研究 。对映体手性识别的研 究目前主要集中于 N M R[7～9 ] 、圆二色光谱[ 10 ] 、X 单晶衍射[ 11 ] 及电喷雾质