河南地方鸡种mtDNA遗传多样性及其进化关系分析.pdfVIP

201O，VOLUME12，N0．1ANIMALBIOTECHNOLOGYBULLETTN 7 河南地方鸡种mtDNA的遗传多样性及其进化关系分析+ 雷雪芹，徐廷生，闰义清，李振红 (河南科技大学动物科技学院，河南洛阳，471003) 引言 我国大约有地方鸡种108个，而在河南省有4个：同始鸡、卢氏鸡、正阳三黄鸡和河南 斗鸡。通过对河南4个地方鸡种的mtDNA D．Loop区的序列测定和分析，探讨其遗传多样 性和遗传分化关系，为进一步探讨河南地方鸡种的起源进化和保种、开发利用提供科学依据。 材料方法 共分析了5个鸡种。同始鸡10个样本，分别标号为GI,--G10；河南斗鸡4个样本，分 别标号为H1—H4；卢氏鸡9个样本，分别标号为LI～L10：正阳三黄鸡9个样本，分别标号 测序。序列用DNAS吖煅软件包进行校正，再用相应的软件进行一系列分析。 结果分析 本研究共测定了37只河南地方鸡和越南斗鸡的mtDNA D．Loop序列，共发现15种单 始鸡10个样本，鉴定出6个单倍型(60％)：卢氏鸡9个样本，鉴定出6个单倍型(66．7％)： 河南斗鸡4个样本，鉴定出3个单倍型(75％)；正阳三黄鸡9个样本，鉴定出4个单倍型 (44．7％)；越南斗鸡5个样本，鉴定出3个单倍型(60％)。5个鸡种均具有丰富的多样度， 说明了这些品种可能具有较长的进化史。从系统发育树可以看出5个鸡种之间的遗传关系， 基本上是以卢氏鸡为代表的和以固始鸡为代表的两大分支，分支I中包含5只卢氏鸡 (62．5％)，包含固始鸡、河南斗鸡、正阳三黄鸡及越南斗鸡各一只分别占(1．1％)。分支II 中包含5只固始鸡(66．7％)和2只正阳三黄鸡(33．3％)。而且这几个鸡品种间均存在基因 交流或分化。在15个单倍型中共有26个突变位点，未发现插入、缺失突变，而全部为置换 突变，并且有的位点同时发生不同类型的置换。 讨论 5个品种的单倍型多态性都很丰富。卢氏鸡的单倍型多样度最大(0．9170)，其它依次为 同始鸡(G)、河南斗鸡(H)、正阳三黄鸡(Z)、越南斗鸡(YD)。表明河南地方鸡种的遗 传多样性是丰富的，而且从核苷酸多样度分析方面也看出了河南地方鸡种的多样性比越南斗 鸡要丰富，表明河南地方鸡种具有较长的进化史。河南地方鸡种可聚为2个类分支。在聚类 分支I中主要是卢氏鸡的单倍型，分支I庄要集聚了同始鸡的单倍型。两个鸡种均处在相对 封闭的环境里，所以其基因的流动较少。陈国宏(2005)研究认为，固始鸡在特定的地理环 境下与其他鸡种的基因交流较少，该研究中也可以看出固始鸡的单倍型聚类很集中。但在分 支I中除了卢氏鸡外其他4个品种的单倍型各出现1次，在分支I庄要除了同始鸩外还有2 个正阳三黄鸡，说明这些品种承载多个血统，它们的遗传背景丰富。尤其在分支I申，由于 正阳三黄鸩和固始鸡的地域关系较近，囡此基冈的交流机会可能更多一些。高玉时等(2006) 认为斗鸡凶其饲养目的与其他鸡种不同导致与其他鸡种的平均遗传距离较远，在本研究中没 有明显的趋势，可能是母系遗传和微卫星的指纹分析依据不同的原因，瓶在本研究中河南斗 Liu 鸡的一个单倍型被分配到第一分支，并发现斗鸡和中国其他鸡种间有共享分支。Yi．Ping (2006)比较了中国斗鸡和日本斗鸡，发现中国斗鸡的单倍型多于日本斗鸡，认为日本斗鸡 来源于中国。本研究发现中国斗鸡的单倍型频率高于越南斗鸡，并且二者有不共享单倍型， 且河南斗鸡的突变位点多于越南斗鸡。 基金项目：河南省基础与前沿计划项目(072300430010)；河南省科技攻关项目(082102130001) ·作者简介：雷雪芹(1962．9．)，女，博士，教授，主要从事动物分子生物学的教学与研究工作， 63．com xueqinlei@1