猪源大肠杆菌差异蛋白质组学分析.pdfVIP

基因组学与应用生物学，2012 年，第31卷，第6期，第531-537 页 GenomicsandAppliedBiology,2012,Vol.31,No.6,531-537 研究论文 ResearchArticle 猪源大肠杆菌O157:H7 与O157 的差异蛋白质组学分析 * 谢宇舟 密克 李军 陈泽祥 许力干 杨威 闭炳芬 禤雄标 潘艳 胡帅 广西兽医研究所, 广西畜禽疫苗新技术重点实验室,南宁,530001 *通讯作者,xjszexiang@163.com 摘 要 为了阐述O157:H7 与O157 的致病力差异与蛋白质表达差异之间的关系，我们利用双向电泳技术 和质谱技术对大肠杆菌两类菌株之间进行蛋白质组学差异分析。菌体蛋白经双向电泳技术分离后，利用软件 TM ImageMaster 2DPlatinum7.0 对所得双向电泳图谱进行差异分析并借助质谱技术对差异蛋白质点进行鉴 定，获得了背景清晰、分辨率高、重复性好的菌体总蛋白的双向电泳图谱。两样品图谱差异分析结果表明，共 确定了28 个有效的蛋白质差异点(Av.ratio 2.0,ANOVA 0.05)，经质谱鉴定将这28 个差异点注释成23 种 蛋白质。对得到注释的23 种蛋白质进行功能分类，发现7类蛋白质与致病性密切相关，即溶菌酶抑制剂、通 用应激蛋白、LuxS、鞭毛蛋白以及3种外膜蛋白。本结果将为进一步研究O157:H7 菌株的致病因子，探究 O157:H7与其它大肠杆菌菌株的致病力差异，以及建立快速鉴别诊断O157:H7 的试剂盒提供重要的依据。 关键词 大肠杆菌,肠出血性大肠杆菌,O157:H7,O157,蛋白质组学,差异表达 DifferentialProteomicAnalysisbetween Escherichia coliIsolatesO157:H7 andO157fromSwine * XieYuzhou MiKe LiJun ChenZexiang XuLigan YangWei BiBingfen XuanXiongbiao PanYan HuShuai GuangxiVeterinaryResearchInstitute,GuangxiKeyLaboratoryofAnimalVaccinesandNewTechnology,Nanning,530001 *Correspondingauthor,xjszexiang@163.com DOI:10.3969/gab.031.000531 Abstract DifferentialproteomicanalysisbetweenE. colistrainsO157:H7andO157wascarriedout,inorderto clarifytherelationshipbetweenvirulenceanddifferentiallyexpressedproteinsofdifferent E. coli strains.Two- TM dimensionalelectrophoresis(2-DE)wasusedtoseparatebacterialproteinsandImageMaster 2DPlatinum7.0 software performed variation analysis of the obtained 2D maps. The differentially expressed proteins were identifiedbymassspectrometry.The2Dmapsofbacterialtotalproteinwithclearbackground,highresolutionand good reproducibility were obtained. The variation analysis of two samples was performed and a total of 28 differentiallyexpressedproteinspots(byfliterAv.ratio 2.0andANOVA 0.05)w