主成分分析法在花生四烯酸高产菌株代谢组学的研究中的应用.pdfVIP

维普资讯 ※生物工程 食 品 科 宇 2008,VoL29,No．07 247 主成分分析法在花生四烯酸高产菌株 代谢组学研究中的应用 李若昕1,2，金明杰2，彭 超2，潘晨亮z，李 霜2，黄 和z (1．华东理工大学 生物反应器工程国家重点实验室，上海 200237； 2．南京工业大学制药与生命科学学院，江苏 南京 210009) 摘 要：利用主成分分析法对于三株花生四烯酸高产高山被孢霉菌株的GC—MS谱图信息进行了分析，以菌株间通 含的18种代谢组分为原始指标，提取出两个主成分变量，在二元主成分平面图上实现了对三个具有不同性状菌株 的良好区分，同时发现主成分 1可能为指向花生四烯酸积累的主成分指标，主成分2可能为指向菌体生长的主成分 指 标 。 关键词：主成分分析；花生四烯酸；高山被孢霉：代谢组学：GC—MS检测 ApplicationofPrincipalComponentAnalysisMethodinM etabolomicsAn alysisofHigh ArachidonicAcid—producnigStains LIRuo—xin ，JINMing-jie，PENGChao，PANChen—liang，LIShuang，HUANGHe (1．StateKeyLaboratoryofBioreacotrEngineering，EastChinaUniversityofScienceandTechnology，Shnaghai 200237，China： 2．CollegeofPharmacynadLifeScience，NanjnigUniversiytofTcehnology，Nanjing 210009，China) Abstract：TheinformationonGC—MSspectraofthree srtainsofhigharachidonicacid—producnigMortierellaalpinewas naalysedbyprincipalcomponentnaalysis，using18commonmeatbolitesas theofigniaivariables．Twoprincipalcompo nents alegotnadthethreesrtainswiht differentcharactersaredistinguished．Athtesametime。principalcomponent1isfoundtobe correspondde wiht arachidonicacidaccumulationnadprincipalcomponent2iscorrespo ndde wiht biomassyield、 Keywords：principalcomponentnaalysis；raachidonicacid：Mortierellaalpina：meatbolomics；GC—MSnaalysis 中图分类号：0657 文献标识码：A 文章编号：1002—6630(2008)07—0247—04 代谢组学分析…是对一个生物系统中所有低分子量 分分析 6【_，】，以探索高产菌株间代谢异同，从而为从代 代谢物质进行全面的定性定量分析 。在微生物代谢工程 谢组学层次进一步提升花生四烯酸发酵生产能力提供理 学中应用[2]目的是从代谢物水平上分析基因变化，结合 论和方法依据f8．91。 转录组学及蛋白质组学以优化细胞体系，提升微生物发 1 材料与方