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HCV分子流行病学的研究进展和意义 赵晶邢文革 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心 分子流行病学是应用先进的技术检测生物学标志 为1-6个型和11个主要的亚型,以a,b,c等表示。 的分布情况,结合流行病学现场研究方法,从分子或 表1HCV基因型各种分型之间的对应关系 Simmonds 基因水平阐明疾病的病因及其相关的致病过程,并研 la lb 2a 2b 3a 3b 4a、5a、6a 究疾病的防治和促进健康的策略和措施。自1989年美 0kamotoI II III IV V K2b l(3 国学者Choo等应用分子克隆技术首先发现丙型肝炎 EnomotoPT Kl K2a K3 GV Mori I II III Iv V Ⅵ CVirus,HCV)以来,HCV的分子生物 Cha G G1IIGⅣ GⅣ 病毒(Hepatitis I GII GⅣ 学、病毒分型、流行特征及与临床关系等方面的研究 都取得了很大进展。以HCV的基因分型作为生物标志 1.3HCV分型方法研究进展 目前HCV分型有多种方法,如:血清学分型法、 markers。biomarkers)进行的分子流行病学 (biological 研究对HCV感染、传播、诊断、诊疗及预防等方面均 型特异PeR分型法、型特异探针杂交法、限制性长度 有重要意义,故本文从HCV的分型和分子流行病学研 多态性分析法(RFIJP)、核酸序列分析法和酶切分型法 究进展等方面进行综述。 等。 l、HCV分型的研究进展 1.3.1血清学分型 1.1HCv的分型依据 利用HCV血清学分型技术是根据HCV某些区域 HCV具有显著异源性和高度可变性,对已知全 表达抗原具有与基因型对应的型别差异,合成特异性 部基因组序列的HCV株进行分析比较其核苷酸和氨基 多肽作为包被抗原,对HCV血清抗体进行分型检测。 Murex 酸序列存在较大差异。并表现HCV基因组各部位的 HCV血清分型试剂盒针对HCVNS4区的特异性 变异程度不相一致,如57.CR最保守,同源性在92.抗体.对HCV进行血清学分型。 7 1.3.2核苷酸序列分析法 100%,而3NCR区变异程度较高,在HCV的编码基 因中,C区最保守、非结构(NS)区次之,编码囊膜 随着核酸测序技术的发展,直接测序分型成为目 蛋白E2/NSl可变性最高称为高可变区。 前具有推广潜力的HCV基因型检测方法。该方法需要 根据现有的HCV分离株数据,HCV基因多样性主对HCVRNA进行巢式PCR扩增,它使用两对引物,进 行两次PCR反应,能够极大地增,JI]PCR扩增反应的敏感 要表现在4个水平: (1)HCV基因组的核苷酸序列的 变异30%时,定为基因型;(2)基因组的核苷酸变异 性和特异性。套式PCR第二次反应的引物(内引物) 位于第一次PCR
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