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2008 14 5 ): 644~649 2008-10-25
应用与环境生物学报 , (
Chin J Appl Environ Biol=ISSN 1006-687X DOI: 10.3724/SP.J.1145.2008.00644
焦化废水生物膜样品和苯酚降解菌
分离株基因盒的分析*
**
张力烨 朱晨光 张晓君 赵立平
(上海交通大学生命科学技术学院 微生物代谢教育部重点实验室 上海 200240)
摘 要 使用59-碱基 (59be)保守序列和整合酶基因的引物进行PCR扩增,研究了焦化废水处理装置中微生物菌群的基
因盒结构,并对两株分离的苯酚降解菌IS-17和IS-46的基因盒进行了扩增测序分析.从5个焦化废水生物膜总 DNA样
品中均获得了基因盒扩增产物.对IS-17和IS-46的基因盒PCR产物克隆建库并测序,通过序列比对等方法来研究和分
析序列的功能 . 发现本研究获得的基因盒与已报道的基因盒在读码框序列、两端引物结合序列、间隔区大小等方面存
在一些不同.本研究结果表明,在焦化废水生物膜菌群中普遍存在基因盒结构,采用基因盒PCR能够从环境或菌株中
获取新基因.图4 表2 参24
关键词 基因盒;整合子;焦化废水;基因盒PCR
CLC X172 : Q78
Analysis of Gene Cassettes with Integrons from Biofilm Samples in Coking
*
Wastewater and Phenol-degrading Bacteria
ZHANG Liye, ZHU Chenguang**, ZHANG Xiaojun ZHAO Liping
(Key Laboratory of Microbial Metabolism ,Ministry of Education, College of Life Science and Biotechnology,
Shanghai Jiao Tong University, Shanghai 200240, China)
Abstract To investigate the structure of integron-gene cassette system of the microorganisms in coking wastewater and
analyze the gene cassette sequences of two strains of phenol degrading bacteria isolated from identical activated sludge, the
gene cassette PCR was performed using the primers designed according to the conserved sequence of the 59 base element
structure and the integrase encoding sequence from class 1 integrons. The result showed that all the biofilm samples in the
coking wastewater and isolated bact
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