花椰菜抗黑腐病消减cDNA文库的构建和分析.pdfVIP

花椰菜抗黑腐病消减cDNA文库的构建和分析.pdf

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第 43卷 第 2期 南 开 大 学 学 报 (自然科学版) Vo1.43 N_O2 2010年 4月 ActaScientiarum Naturalium UniversitatisNankaiensis Apr.2010 文章编号 :0465—7942(2010)02—0015—08 花椰菜抗黑腐病消减 eDNA文库的构建和分析 江汉民,郝 擘 ,于雪梅 ,李 爱 ,王春国,孙德岭。,宋文芹 (1.南开大学 生命科学学院,天津 300071;2.天津科润蔬菜研究所 ,天津 300384) 摘要:为全面探索花椰菜抗黑腐病的机理,以花椰菜抗黑腐病近等基因系C712(抗病系)和 C731(感病系) 为试验材料 ,构建了一个 C712受黑腐病菌诱导表达的正 向消减 eDNA文库 ,文库共包含 1476个 阳性克隆.经 斑点杂交筛选后选择了280个阳性克隆进行测序,获得 266条通读 ESTs.将获得的ESTs去除载体和接头序列 以及重复序列后 ,共得到 202条单一序列.利用 NCBI的BlastX软件对所得序列进行蛋 白序列 同源性 比对 ,结果 显示,182条序列在蛋 白数据库中可以找到同源序列,主要涉及物质及能量代谢、信号传导、转录调控、苯丙氨酸 代谢途径及防卫反应等方面.2O个ESTs在GenBank中没有查到对应 的同源序列 ,可能是新基 因.eDNA文库 的 构建为进一步研究花椰菜抗黑腐病相关基 因及抗病的分子机制奠定了基础. 关键词 :花椰菜 (Brassicaoleraceawar.botrytis);黑腐病 ;cDNA文库 ;抑制性消减杂交 中图分类号 :Q75 文献标识码 :A 0 引 言 花椰菜 (Brassicaoleraceavar.botrytis)是十字花科芸薹属甘蓝的一个变种,具有较高的营养价值和一 定的抗癌功效 ,深受人们的喜爱 ,近年来在我 国的种植面积越来越大 ,但随着菜 田复种指数的提高和生态 条件的改变 ,由野油菜黄单胞杆菌(Xanthomonascampetrispv.campetris,Xcc)引起的黑腐病的发病率越 来越高 ,为害 日趋严重 ,直接影响花椰菜花球的产量和品质 ,成为生产上迫切需要解决的问题.研究花椰菜 抗黑腐病 的机制 ,寻找抗病育种新方法是解决此问题的有效途径.抑制性消减杂交技术 (suppressionsub— tractivehybridization,SSH)是一种快速有效分离差异表达基因的方法 ,对高、低丰度的差异表达基 因均能 有效分离 川.以抗黑腐病的花椰菜 C712及其感病 的近等基 因系(near—isogeniclines,NILs)C731为材料, 利用 SSH技术富集在 Xcc侵染后抗黑腐病品系中差异表达的基 因,构建 ssHcDNA文库.通过基因功能 分析,初步 了解抗病花椰菜在与 Xcc的互作 中涉及的信号传导途径及抗病相关基因表达 的种类 、数量 以 及功能,为进一步认识花椰菜抗黑腐病的机制 ,挖掘和利用花椰菜重要抗病基因奠定基础. 1 材料与方法 1.1 材料 所采用的植物材料为一对花椰菜抗黑腐病的NILsC731和 C712品系 ,其 中C731为感病系作为回归 亲本 ,C712是供体亲本 C5与 C731杂交后得到的抗性植株 ,并与C731回交 6代得到的抗病系(BCeFz). 所用致病菌为野油菜黄单胞菌 (Xanthomonascampetrispv.campetris,Xcc),以上材料 由天津科润蔬菜研 究所提供. 1.2 方法 1.2.1 材料的处理 :供试材料的种子在 5O。C水中处理 10min,然后播种于装有灭菌土的营养钵 内,置于 温室 中.待植株长到 4片叶时,对植株进行处理.致病菌 的接种及样品的采集参照文献[2]进行. 收稿 日期 :2009—02—18 基金项 目:国家 973计划前期研究专项 (2007CB116202) 作者简介 :江汉 民(1981一),男 ,山东青州人 ,博士研究生 ·16 · 南 开 大 学 学 报 (自然科学版) 第 43卷 1.2.2 叶片总 RNA 的提取与 mRNA 的分离、纯化

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