基于CHARMM力场的蛋白质分子场计算及触觉感知.pdfVIP

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2017-08-29 发布于江西
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基于CHARMM力场的蛋白质分子场计算及触觉感知.pdf

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基于CHARMM力场的蛋白质分子场计算及触觉感知.pdf

第21卷第7期计算机辅助设计与图形学学报 V01．21，No．7 COMPUTER—AIDED GRAPHICS 2009年7月 JOURNAI。OF DESIGN＆．COMPUTER July，2009 基于CHARMM力场的蛋白质分子场计算及触觉感知汪莉万华根’ 彭群生 8L 310027) (浙江大学CADCG国家重点实验室杭州 (1iwang@cad．zju．edu．cn) 摘要分子场是研究分子结构与功能的重要工具之一，已经成为药物设计和分子对接的常规方法．由于触觉设备能提供丰富的感官信息。近年来触觉交瓦正逐渐成为该领域的研究热点．文中研究了蛋白质分子场的触觉感知．首先从蛋白质分子结构出发，基于CHARMM力场。经过分子动力学模拟采样计算得到蛋白质分子场；然后结合触觉设备建立触觉感知模型．通过视觉与触觉相结合的方式分析分子场能量分布以丰富分子场的感知信息；最后绘制触觉场景并给用户提供相关的视觉和触觉反馈．实验结果表明，文巾提出的分子场计算方法鲁棒，且触觉系统能保持较好的稳定性．关键词分子场；触觉；力反馈；静电势能；范德华势能；分子对接；药物设计中图法分类号TP391 and ofProteinInteractionFieldsBasedon ComputationHapticApplication CHARMMForceField Li WanH Wang uagen。PengQunsheng (State 310027) KeyLaboratoryofCADCG．ZhejiangUniversity，Hangzhou Abstract an tOOlfor theintrinsic Molecularinteractionfield(MIF)is important studying betweenmolecularstructureandfunction．Ithasbeenestablishedasa conventional relationship methodinrational andmolecular canbe user a docking．MIF through drugdesign experiencedby device．Inthis of interactionfieldsis haptic paper，thehapticapplicationprotein MIFis on structureofa themolecular constructedbasedthemacromoleeular proteinbycomputing withthe force a modelis withwhichthe CHARMMfield．Then developed dynamics hapticperceptual MIF distributionis both and toaffordmuchrichersensational visuallyhaptical