基于新一代测序技术的全基因组表达谱分析.pdfVIP

BGI-Sequencing 华大基因科技服务 基于新一代测序技术的全基因组表达谱分析 通过对样本中数以百万计的mRNA 标签进行序列测定，新一代测序技术可以 使研究人员对特定组织或器官进行数字化的分析，而成本与目前其他模拟化分析 技术接近。由于我们的技术无需利用任何基因特异性杂交探针，您可以同时进行 基因表达的定性与定量分析，而无需事先知道基因组的注释情况。 一、技术路线 见图1-1。 图1-1 表达谱分析技术路线 基于新一代测序技术的全基因组表达谱分析方法具有如下无可比拟的优势： 1. 数字化信号：直接测定每个基因的特异性表达标签序列，通过计数表达标签 序列的数目来确定该基因的表达量，大大提高了定量分析的准确度。整体表 达差异分布符合正态分布，不会因为不同批次实验引起不必要的误差； 1 BGI-Sequencing 华大基因科技服务 2. 可重复性高：不同批次的表达谱度量准确，能够更准确的进行表达差异分析； 3. 高灵敏度：对于表达存在差异的基因能够灵敏的检测其表达差异；能够检测 出低丰度的表达基因； 4. 全基因组分析：由于该技术不用事先设计探针，而是直接测序的方式，因此 无需了解物种基因信息，可以直接对任何物种进行包括未知基因在内的全基 因组表达谱分析； 5. 高通量测序：已有数据表明，当测序通量达到200 万个表达标签时，即可得 到样本中接近全部表达基因的表达量数据，而目前每个样本分析可以得到 300 万~600 万个表达标签； 6. 无需重复实验； 7. 可同时发现新的转录本、基因组表达调控区域等； 8. 高性价比，完整深入的生物信息学分析支持。 该方法已经应用于各个物种的不同组织、器官等差异表达基因的研究及功能 基因组研究等领域。近来又被广泛应用于包括各种疾病在内的临床医学研究等领 域。 根据案例分析和比较分析（详情见下），新一代测序技术的全基因组表达谱 分析方法的优势： 优势 具体内容 数字化信号 案例分析内容1、图2-1 可重复性好 图3-1、图2-2 高灵敏度 图2-2 、图2-4 、图3-3 全基因组分析 案例分析内容5 高通量测序 案例分析内容1 无需重复试验 案例分析内容2 、3 可检测新转录本、基因调控 案例分析内容5、比较分析内容6 高性价比 比较分析内容7 Tips: 新一代测序技术的全基因组表达谱的特点： 1．Tag 长度约为20~21bp ； 2 ．高通量：一次可以测得200 万以上的Tag ； 3 ．测序技术而非杂交技术； 4 ．高性价比，我们提供全套的实验设计、上机到生物信息分析的完整解决方案。 利用表达谱数据，客户可以很容易的得到样品间的表达差异。准确、灵敏的 捕捉到不同样品间差异表达的基因。为后续的分析提供十分可靠的参考基因集 合。此外，我们将对差异表达的基因进行十分全面、深入的各类功能注释、信号 通路等相关分析。力求最大限度的提供给客户最可靠、最全面的信息。 二、新一代测序技术同芯片技术的比较分析 1．Ratio 的分布 2 BGI-Sequencing 华大基因科技服务