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免疫选择压力对丙型肝炎病毒高变区基因变异的影响
摘 要
\目前全世界大约有1.79亿人感染丙型肝炎病毒(Hcv)…,且80%以上
的感染者形成与慢性肝炎、肝硬化、肝衰竭及肝细胞癌相关的持续性感染。
由于受到缺乏体外复制系统的限制,HCV发病机理的研究还局限于
HCV感染自然史的观察和黑猩猩的实验感染。从黑猩猩实验感染所得的数
据与人的存在一定的差异,而差异的程度尚不清楚,这就是黑猩猩的实验
数据不能很好地解释入感染HCV发病机理的原因。目前在研究免疫选择
压力与HCV变异方面主要存在两个问题:一是黑猩猩与人的免疫选择压
力的差异是怎样的;二是由于缺乏HCV感染的免疫缺陷动物模型作对照
研究,对免疫选择压力在HCV变异中的作用研究不够深入。由于同义替
换率在诸多影响基因变异的因素中反映的是病毒的复制速率,而非同义替
换则反映的是免疫选择压力。因此寸本研究采用同时进行单链构象多态
conformational
(single—stranded
(heteroduplex
猩猩间传代和持续感染时准种的演变,并与人慢性HCV感染进行比较,
以说明黑猩猩与人对HCV的免疫选择作用的差异;②人免疫缺陷病毒(HIvl
感染常导致机体免疫缺陷,利用HCV感染者重叠HⅣ感染后免疫功能低
下这一“模型”作对照,观察免疫功能低下者与正常者间HCV准种的演
变,以阐明机体免疫压力对HCV变异的作用。
‘7主要结果如下:
、1.观察了6只传代感染的黑猩猩急性期(接种后4~ll周)标本,2只(v4,
SSCP/HDA分析,急性期的克隆型比率(clonotyperatio)中位数,与人急性
RNA阳性标本的克隆型比率相近。
感染首次HCV
多数的克隆型,而P2发展为持续的病毒血症。与传代感染相反,形成慢
性感染的P2和x304其急性和慢性期没有共同的克隆型存在。
3.急性和慢性感染的黑猩猩的HCV的克隆型比率都是增高的,在6
个慢性HCV感染的患者中,有4人HCV克隆型比率是增加的,而患者
AT和AZ的准种复杂性降低的。前者感染的是1a亚型,后者感染的是1b
亚型。
4.急性期黑猩猩的HCV序列发生替换的频率降低;相反,慢性感染
的黑猩猩HCV基因替换率较高,形成了许多单一的序列。
5.急性和慢性期平均遗传距离黑猩猩低于人类,基因替换率亦是黑
猩猩较低。慢性感染的黑猩猩的基因替换大部分是同义替换,结果氨基酸
序列没有改变;而在人类基因替换大部分是非同义的,结果导致氨基酸序
列的改变。
6.除P2
HVRI第三个氨基酸残基被精氨酸替换外,每一动物的HVRl
序列与H77的完全相同,且x304的急慢性期的亦相同。
7.免疫抑制与HCV复杂性降低有关,本研究发现从post.SCl到
post—SC2有4例进展缓慢者克隆型比率增高,有3例进展迅速者HCV克
隆型比率降低。并发现克隆型比率的变化与血清病毒载量无明显关系。
了观察,所有10患者非同义替换大多发生在HVRl区,且dN/dS也是最
高,进展迅速组HVRl的dN/dS范围包含了进展缓慢组。10例中7例HIV
感染后dN/dS较感染前低,进展迅速组的平均dN/dS也低于进展缓慢组。
9.在HIV感染前也存在,即进展迅速者感染HIV前dN/dS就较进展
缓慢者低。提示在HIV感染早期虽然存在免疫抑制,但可能还有比HIV
感染更有意义的其他因素影响HCV序列的演变。、)
广
结论:
1.们发现黑猩猩的dN/dS是低的,而又不能用强有力的负选择作用
来解释,说明黑猩猩对HCV准种形成的正选择压力较人的为弱。这些发
现对于解释黑猩猩感染HCV模型所得的数据具有重要意义,并且支持在
低选择压力下优势株序列的变异低的观点。
2.虽然目前对影响HCV序列演变的因素了解很少,而本研究结果可
证明慢性感染不引起非同义变异的积累。这一发现提示免疫功能可通过检
测准种非同义变异来验证,这是对现有检测宿主与病毒关系方法的补充。
比例降低,提示HIV感染导致机体对HCV的免疫选择压力下降,但并未
证实早期HIV感染对HCV序列演变产生具有统计学意义的显著影响。仍
需进行更多研究以了解HIV是如何改变丙型肝炎进程的。
4.初步发
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