不同饲养条件下内蒙古绒山羊瘤胃甲烷菌组成的研究.pdfVIP

不同饲养条件下内蒙古绒山羊瘤胃甲烷菌组成的研究.pdf

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O C T ^ A6RICULTURAE 华北农学报 ·2010,25(5):228.233 BOREOLI-SlHICa 不同饲养条件下内蒙古绒 山羊瘤 胃甲烷菌 组成 的研究 李长青 ,金 海 ,栗原光规 (1.内蒙古农牧业科学院 生物技术研究 中心 ,内蒙古 呼和浩特 010031;2.日本 国家农业生物资源 研究所 动物科 学研究组 ,日本 茨城 305—0901) 摘要 :为了解天然放牧和舍饲条件下内蒙古绒 山羊瘤 胃中甲烷菌的种群组成 。选取 甲烷菌 mcrA基因的特异性 引物序列 ,利用 PCR技术对从瘤 胃液 中抽提的细菌总 DNA进行扩增 ,并建立 了甲烷菌特异性 的mcrA基 因文库。用 限制性内切酶 TaqI对该文库特异性片段进行了限制性酶切片断长度 多态性分析 (Restrictionfragmentlengthpolymor— phism,RFLP)。放牧和舍饲 内蒙古绒山羊瘤 胃中甲烷菌的mcrA基因片段被分成 6个不同的RFLP类型,并由此建立 了DNA指纹图谱 ;系统发育树分析表 明,其属于 甲烷杆菌 目和 甲烷微菌 目,且绒山羊瘤 胃中的 甲烷菌大部分属于 甲 烷短杆菌。放牧绒山羊瘤 胃内甲烷菌种类 比舍饲绒山羊更加丰富,6种 甲烷菌所 占比例均较高,而舍饲绒 山羊只有两 种优势菌 比例较高,其他几种所 占比例极低 。 关键词 :甲烷菌 ;mcrA基 因;瘤 胃液 ;绒 山羊 中图分类号 :$827 文献标识码 :A 文章编号:1000—7091(2010)05—0228—06 StudiesonM ethanogeasComposition ofInnerM ongolia CasmereGoatRumen inDifferentFeedingCondition LIChang—qing ,JIN Hai,MitsunoriKURIHARA (1.BiotechnologyResearchCenter,InnerMongoliaAcademyofAgriculturalandAnimalHusbandryScience, Huhhot 010031,China;2.DivisionofAnimalSciences,NationalInstituteofAgrobiologicalSciences, Ibaraki 305—0901,Japan) Abstract:Inordertoanalyzethemethanogen speciescomposition intherumenfrom grazingandbarnfeeding cashmeregoatrespectively.A pairofmcd genespecificprimerswasdesigned,andtotalmicrobialgenomicDNAofru- menliquidwasextractedbythedirectmethodofPCR—amplificationtemplate.ThenamcrA genespecificDNA clone librarywassubsequentlyconstructed.AndRFLPanalysisofmcrAgenewasconductedusingenzymes(TaqI)todigest mcrA generfom thelibrary.Therandomlyselectedclonedrfagmentswerefinallyclusteredinto6differentphylotypes, andcontructtheDNA fingerprintpatternsfrom it.Throughthephylogenetictreesanalyzing,Methanogen incashmere goat/qlmenbelongtomethanobacterialesandmethanomicrobiales,andthepreponderantmetha

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