生物信息学在昆虫几丁质酶研究中的应用.docVIP

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 生物信息学在昆虫几丁质酶研究中的应用# 仙笑笑,范晓军,宋志芳,李瑶** (太原理工大学化学化工学院生物与制药工程系,太原 030024) 5 10 15 20 25 30 35 40 摘要:生物信息学是 20 世纪 80 年代末兴起的一门新兴的交叉学科,随着基因组和蛋白组研 究的不断发展,生物信息学在众多生物学领域发挥着越来越大的作用。几丁质是构成大多数 真菌细胞壁的主要成分之一,同时也大量存在于昆虫和无脊椎动物的甲壳中。昆虫几丁质酶 能把几丁质水解为低分子量的 N-乙酰-D-氨基葡萄糖或寡聚 N-乙酰胺基葡萄糖。在昆虫几丁 质酶基因克隆、结构分析、同源性比较等方面应用生物信息学方法可获得大量的生物学数据, 为后续实验提供科学依据。本文主要对生物信息学在昆虫几丁质酶研究中的应用及展望做了 全面的综述。 关键词:生物信息学;昆虫几丁质酶;应用 中图分类号:Q7 Application of bioinformatics in the study of insect chitinase XIAN Xiaoxiao, FAN Xiaojun, SONG Zhifang, LI Yao (Department of Biological and Pharmaceutical Engineering, College of Chemical Engineering and Technology, Taiyuan University of Technology, TaiYuan 030024) Abstract: With the continuous development of genomics and proteomics, bioinformatics which formed in the late 1980s as an emerging cross-disciplinary played an important role in many biological areas. Chitin is a major component of the most fungal cell wall, as well as the carapace of insects and invertebrates and can be hydrolyzed by chitinase into low molecular weight N-acetyl-D-glucosamine or oligomeric N-acetyl amino glucose.Vast quantities of biological data have been obtained by bioinformatics methods which applied in insect chitinase gene cloning, structural analysis, homology comparison and valid scientific data achievement for later experiments. This article summarizes the bioinformatics, insect chitinase and applications of bioinformatics in study of insect chitinase. Keywords: Bioinformatics; Insect Chitinase; Application 0 引言 随着重组 DNA 技术和计算机科学的发展, 基因组研究开始兴起,特别是人类基因组计 划的实施,在基因组与蛋白质组序列的测定、蛋白质结构及功能的预测等方面的研究中,科 学家们获得了大量的分子生物学原始数据,综合利用数学、物理、计算机等学科分析处理这 些数据,即产生了生物信息学。目前生物信息学正在医药、农业、保健等众多领域发挥着巨 大的影响力。 昆虫几丁质酶是一种能把几丁质水解为低分子量的 N-乙酰-D-氨基葡萄糖或寡聚 N-乙 酰胺基葡萄糖的糖蛋白,几丁质又称甲壳素或壳多糖,是构成大多数真菌细胞壁的主要成分 之一,同时也大量存在于昆虫和无脊椎动物的甲壳中,但高等动植物和人体内不含有几丁质, 因此昆虫几丁质酶广泛应用于农业、生命科学以及环境科学等方面。通过生物信息学的相关 手段可以更好的了解昆虫几丁质酶的特性,目前生物信息学已应用于昆虫几丁质酶基因序列 测序、基因的电子克隆、预测新基因、预测蛋白质的二、三级结构、构建分子进化树等方面, 并为人们更好的了解昆虫几丁质酶的理化性质、体外表达特征及酶学性质提供有力的帮助。 基金项目:国家自然科学基金项目;

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