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生物信息分析师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种工具常用于二代测序(NGS)数据的比对(Mapping)?
A.GATK
B.BWA
C.DESeq2
D.InterProScan
答案:B
解析:BWA(Burrows-WheelerAligner)是经典的短读长序列比对工具,适用于NGS数据与参考基因组的比对。A选项GATK是变异检测与分析工具;C选项DESeq2用于RNA-seq差异表达分析;D选项InterProScan用于蛋白质功能域注释,均不符合比对功能。
在RNA-seq数据分析中,“FPKM”指标用于衡量:
A.测序数据的错误率
B.基因的表达量
C.基因组的杂合度
D.测序数据的GC含量
答案:B
解析:FPKM(FragmentsPerKilobaseoftranscriptperMillionmappedreads)是标准化后的基因表达量衡量指标,通过校正基因长度和测序深度计算。A选项错误率由Q值评估;C选项杂合度通过K-mer分析或SNP密度评估;D选项GC含量通过质控工具(如FastQC)直接统计。
以下哪个数据库主要存储蛋白质三维结构信息?
A.NCBIGenBank
B.UniProt
C.PDB(ProteinDataBank)
D.Ensembl
答案:C
解析:PDB专门存储蛋白质、核酸等生物大分子的三维结构数据。A选项GenBank是核酸序列数据库;B选项UniProt是蛋白质序列与功能数据库;D选项Ensembl是基因组注释数据库。
在全基因组重测序(WGS)分析中,“SNPcalling”的主要目的是:
A.检测插入缺失(Indel)
B.识别单核苷酸多态性
C.组装基因组
D.分析拷贝数变异(CNV)
答案:B
解析:SNPcalling(单核苷酸多态性检测)的核心目标是识别样本与参考基因组之间的单碱基差异。A选项Indel检测是独立步骤;C选项基因组组装是从头测序(denovo)的任务;D选项CNV分析需通过覆盖度或结构变异检测工具完成。
用于评估测序数据质量的关键指标“Q30”表示:
A.错误率为1%的碱基比例
B.错误率为0.1%的碱基比例
C.测序深度为30X
D.GC含量为30%
答案:B
解析:Q值计算公式为Q=-10×log??(P),其中P为碱基错误概率。Q30对应错误率P=10?3(0.1%),即99.9%的碱基正确。A选项对应Q20(错误率1%);C、D与Q值无关。
以下哪种文件格式常用于存储测序原始数据?
A.BAM
B.FASTQ
C.VCF
D.GTF
答案:B
解析:FASTQ是包含测序读长(reads)及其质量值的标准格式,用于存储原始测序数据。A选项BAM是压缩的比对结果格式;C选项VCF存储变异信息;D选项GTF存储基因注释信息。
在ChIP-seq数据分析中,“Peakcalling”的主要作用是:
A.检测转录因子结合位点
B.计算基因表达量
C.预测蛋白质结构
D.分析甲基化水平
答案:A
解析:Peakcalling(峰检测)通过比对后的ChIP-seq数据与输入对照(Input)的差异,识别转录因子或组蛋白修饰的结合区域(即结合位点)。B选项是RNA-seq的任务;C选项需结构预测工具;D选项是甲基化测序(Bisulfite-seq)的分析内容。
三代测序(如PacBio)的主要优势是:
A.测序成本低
B.读长极长
C.错误率低
D.通量极高
答案:B
解析:三代测序(如PacBio的HiFi、Nanopore)的核心优势是单读长可达数万至数十万个碱基(长读长),能解决重复序列和复杂结构变异。A、D是二代测序(NGS)的优势;C错误,三代原始数据错误率较高(~10-15%),需通过纠错降低。
以下哪个工具用于宏基因组数据的物种组成分析?
A.HISAT2
B.MetaPhlAn
C.StringTie
D.BLAST
答案:B
解析:MetaPhlAn是宏基因组物种分类的专用工具,通过标记基因(如rRNA)进行物种组成分析。A选项HISAT2用于RNA-seq比对;C选项StringTie用于转录本组装;D选项BLAST用于序列相似性有哪些信誉好的足球投注网站。
在单细胞RNA-seq(scRNA-seq)分析中,“降维”步骤常用的算法是:
A.K-means
B.PCA(主成分分析)
C.DESeq2
D.BWA
答案:B
解析:scRNA-seq数据维度高(数万个基因×数万个细胞),需通过PCA等降维算法(如t-SNE、UMAP)简化数据,保留关键变异信息。A选项K-means是聚类算法;C选项DESeq2用
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