2025年大学《生物信息学》专业题库—— 中药成分与靶点蛋白预测技术.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——中药成分与靶点蛋白预测技术

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、选择题（每题2分，共20分）

1.在进行中药活性成分-靶点蛋白分子对接时，通常需要为靶点蛋白准备哪种格式的结构文件？

A.FASTA序列

B.PDB或SDF

C.SMILES字符串

D.KEGG通路图

2.以下哪个数据库主要收录了中草药的化学成分信息？

A.SwissProt

B.DrugBank

C.TCMSP

D.PubMed

3.分子对接计算中，结合能（如DockQ,RMSD）的数值通常代表什么？

A.形成稳定复合物所需的最低能量

B.分子间作用力的总和大小

C.接头与对接位点之间的距离

D.蛋白质变性的能量阈值

4.QSAR模型（如CoMFA,CoMSIA）的核心思想是？

A.基于已知结合蛋白的结构进行模板匹配

B.通过统计分析化合物结构与活性之间的关系

C.利用机器学习预测蛋白质的序列保守性

D.基于分子动力学模拟预测长期相互作用

5.对于具有多种潜在靶点的中药成分，选择预测靶点时不应主要考虑？

A.该靶点与中药已知功效的关联度

B.靶点在相关信号通路中的核心地位

C.该靶点是否已被其他多种药物靶向

D.预测方法对该靶点预测准确性的历史表现

6.在中药成分预测其ADME（吸收、分布、代谢、排泄）特性时，哪个参数通常被认为是最重要的药代动力学筛选指标？

A.LogP（亲脂性）

B.LogS（水溶性）

C.Mw（分子量）

D.HBA（碱性氢原子数）

7.基于已知药物-靶点复合物结构进行虚拟筛选时，常用的策略是？

A.将候选化合物库中的分子随机投入靶点口袋进行对接

B.仅选择与已知活性化合物结构相似度高的分子进行对接

C.对靶点进行序列比对，筛选与已知活性位点序列相似的候选化合物

D.基于靶点序列的理化性质预测与已知活性化合物的相似性

8.分子动力学（MD）模拟在中药-靶点相互作用研究中的主要目的是什么？

A.精确计算结合自由能

B.预测蛋白质的二级结构

C.模拟蛋白质-配体复合物在生理条件下的动态行为

D.直接设计出最优的药物分子结构

9.如果一个基于QSAR模型预测的化合物具有高活性，但在分子对接时与靶点蛋白的相互作用能较差，可能的原因是什么？

A.QSAR模型本身存在偏差

B.分子对接参数设置不当

C.该化合物在生理条件下可能存在构象异构体

D.以上所有原因均有可能

10.中药复方成分极其复杂，对其进行成分-靶点预测时，一个重要的挑战在于？

A.预测结果可能受到多种成分的协同或拮抗作用影响

B.难以从中准确筛选出具有生物活性的单一化合物

C.常用的预测方法大多基于单一化合物-单一靶点模式

D.复方中难以明确区分哪些成分是真正的活性成分

二、填空题（每空1分，共15分）

1.预测中药成分与靶点蛋白相互作用常用的计算方法主要包括分子对接、______、药效团模型和定量构效关系（QSAR）等。

2.获取中药成分结构信息，除了公共数据库如PubChem、DrugBank外，常用的特定数据库有TCMSP和______。

3.分子对接中，评估对接结果好坏的指标除了结合能外，还有______和根均方偏差（RMSD）。

4.QSAR模型中的“构效关系”是指化合物结构与其生物______之间的定量或定性关系。

5.对于缺乏实验验证的预测结果，需要考虑其______和______，并结合其他信息进行综合判断。

6.在利用SwissTargetPrediction等工具预测靶点时，通常需要输入化合物信息（如SMILES或名称）和靶点所属的______（如KEGGpathwayID）。

7.中药成分的理化性质，如______、分子量（Mw）和碱性氢原子数（HBA），是预测其口服生物利用度（OralBioavailability）的重要参数。

三、简答题（每题5分，共15分）

1.简述分子对接技术预测药物靶点的基本流程。

2.简要比较分子对接和QSAR两种预测方法在中药成分-靶点预测中的主要区别和适用场景。

3.当预测到一个中药成分可能作用于多个靶点时，如何初步判断哪些靶点可能与其主要功效相关？

四、计