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实时荧光定量PCR检测方法的实际应用分析案例
目录
TOC\o1-3\h\u4079实时荧光定量PCR检测方法的实际应用分析案例 1
23351.1材料和仪器 1
48541.1.1材料 1
223151.1.2主要试剂 2
244661.1.3仪器设备 2
63321.2试验方法 2
168471.2.1增菌方法对比 2
96801.2.2增菌试验 3
13631.2.3样品验证 3
22151.3试验结果 4
30131.3.1增菌方法的选择 4
171661.3.2增菌试验结果 5
254621.3.3果汁样品验证结果 6
222451.4总结 8
由于实际浓缩苹果汁样品中脂环酸芽孢杆菌含量较低,无法达到所建立检测方法的检测限。为了使建立的方法能够应用到实际工厂检测中,尝试多种富集增菌方法尽量缩短不同浓度、不同菌种达到检测限的富集时间。另外,对果汁样品进行检测,完善样品检测流程,为果汁加工企业检测脂环酸芽孢杆菌提供可靠的技术方法,最终得到快速、简便、高效的检测方法。
1.1材料和仪器
1.1.1材料
脂环酸芽孢杆菌属A.acidoterrestris(DSM3923)、A.acidiphilus(DSM14558)、A.cycloheptanicus(DSM4006)、A.herbarius(DSM13609)购自德国生物材料资源中心(DSM),所有菌株均保存在-80℃冰箱中。浓缩苹果汁来自于国投中鲁股份有限公司乳山研发中心。菌株培养条件见表4-1。
AAM固体培养基:制备A溶液和B溶液,灭菌(121℃×20min)。
A:酵母浸粉2.0g,硫酸铵0.4g,硫酸镁1.0g,磷酸二氢钾1.2g,氯化钙0.38g,500mL蒸馏水,用1mol/LH2SO4或1mol/LNaOH调pH至1.0。
B:琼脂20.0g,葡萄糖2.0g,溶于500mL蒸馏水中加热溶解。为防止琼脂在酸性条件下水解,待A溶液和B溶液灭菌后冷却至50℃,将A溶液和B溶液混合,尽量避免产生气泡。
AAM液体培养基:酵母浸粉2.0g,葡萄糖2.0g,硫酸铵0.4g,硫酸镁1.0g,磷酸二氢钾1.2g,氯化钙0.38g,蒸馏水1L,用1mol/LH2SO4或1mol/LNaOH调pH至1.0。(121℃×20min)杀菌。
表4-1菌株培养条件
Table4-1Straincultureconditions
编号
种属
培养基
温度
DSM3923
A.acidoterrestris
AAM
45℃
DSM14558
A.acidiphilus
AAM
45℃
DSM4006
A.cycloheptanicus
AAM
45℃
DSM13609
A.herbarius
AAM
55℃
1.1.2主要试剂
试验所用主要试剂如表4-2所示。
表4-2主要试剂
Table4-2Mainreagents
试剂名称
生产厂家
纯度
琼脂
四川西陇化工有限公司
AR
乙醇
四川西陇化工有限公司
AR
丙三醇
四川西陇化工有限公司
AR
氯化钠
四川西陇化工有限公司
AR
葡萄糖
四川西陇化工有限公司
AR
硫酸铵
四川西陇化工有限公司
AR
硫酸镁
四川西陇化工有限公司
AR
氯化钙
四川西陇化工有限公司
AR
磷酸二氢钾
四川西陇化工有限公司
AR
可溶性淀粉
四川西陇化工有限公司
AR
酵母浸粉
北京奥博星生物技术有限责任公司
AR
2×UltraSYBRMixture
天根生化科技(北京)有限公司
AR
1.1.3仪器设备
试验所用主要试剂同表2-2。
1.2试验方法
1.2.1增菌方法对比
根据前期灵敏度试验结果得知A.acidoterrestris(DSM3923)的检出限为2.6×102CFU/mL;A.acidiphilus(DSM14558)的检出限为7.4×101CFU/mL;A.cycloheptanicus(DSM4006)的检出限为2.8×102CFU/mL;A.herbarius(DSM13609)的检出限为3.1×102CFU/mL。由于实际苹果浓缩汁样品中脂环酸芽孢杆菌含量一般较低,初期不能检出。为进一步提高检测效率,现采用两种方法进行快速增菌试验,使细菌快速生长至可检测的浓度,并确定四株菌在不同培养浓度下达到检出限的培养时间。
选取A.acidoterrestris(DSM3923)作为试验菌株进行两种增菌方法的对比。取保藏在-80℃超低温冰箱中的DSM3923,将保存菌株接种
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