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分子植物育种,2025年,第23卷,第1期,第4619-4629页
MolecularPlantBreeding,2025,Vol.23,No.14,4619-4629
研究报告
ResearchReport
樱花MYB转录因子家族全基因组鉴定与分析
1,2222222*
屈雨飞沈鑫蒋冬月李因刚孙泽硕陈百强柳新红
1浙江农林大学林业与生物技术学院,杭州,311300;2浙江省林业科学研究院,杭州,310023
*通信作者,lsliuxh@163.com
摘要本研究利用钟花樱转录组测序结果,建立钟花樱的数据库,从中筛选MYB类型的转录因子,并利
用生物信息学分析方法对其蛋白分子量、等电点、亲水性、脂溶性、亚细胞定位、蛋白二级结构、基因在染色体
上分布的位置、基因序列结构、保守序列和进化关系等展开研究,解析MYB转录因子在钟花樱生长发育过
程中的生物学功能。结果表明,本研究中的171个MYB转录因子,大部分为不稳定的亲水性蛋白,其氨基酸
数目在7到1037个之间,分子量范围为8530.15至113977.49Da,等电点在4.3到11.16;亚细胞定位预
测结果,共有6个MYB基因定位于细胞核,89个定位于细胞质;蛋白二级结构结果显示,大部分成员的二
级结构主体是-螺旋和无规卷曲;钟花樱MYB基因家族成员中有167个分布在8条染色体上,其余个
琢
成员游离在染色体之外;通过与拟南芥的MYB转录蛋白的序列进行进化分析,将其分为21个亚组;基因结
构和motif分析显示,同一亚组的家族成员,其基因序列结构排布方式和蛋白保守序列排列方式具有高度相
似性。本研究的结果为后续关于钟花樱MYB转录因子家族成员的功能验证做了铺垫,也为其他物种MYB
转录因子家族的研究提供了一定的理论支持。
关键词钟花樱;MYB转录因子;全基因组鉴定;生物信息学
Genome-wideIdentificationandExpressionAnalysisoftheMYBTran-
scriptionFactorFamilyinPrunuscampanulata
1,2222222*
QuYufeiShenXinJiangDongyueLiYingangSunZeshuoChenBaiqiangLiuXinhong
1CollegeofForestryandBiotechnology,ZhejiangAFUniversity,Hangzhou,311300;2ZhejiangAcademyofForestry,Hangzhou,310023
*Correspondingauthor,lsliuxh@163.com
DOI:10.13271/j.mpb.023.004619
AbstractUsingthetranscriptomesequencingresults,adatabaseofPrunuscampanulatawasestablishedofPrunus
campanulata,MYB-typetranscriptionfactorswerescreenedbybioinformaticsanalysis,andthemolecularweight
ofproteins,isoelectricpoint,hydrophilicity,lipidsolubility,subcellularlocalization,secondarystructureelements,
chromosomallocalization,genesequencestructure,conservedsequencesandevolutionaryrelationshipsofthese
geneswerealsoanalyzed.AimingtoclarifythebiologicalfunctionsofPcMYBtranscriptionfactorsinthegrowth
anddevelopmentofPrunuscampanulata.Theresultsshowedthatthe171PcMYBtranscriptionfactors,mostof
themwereunstableandhydrophilicexpressedprote
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