单一顺序和重复顺序.pptVIP

单一顺序和重复顺序;优选第节单一顺序和重复顺序;正向重复：;;反向重复(Invertedrepeats)：;第6页，共38页。;第7页，共38页。;画上荷花和尚画;在高度重复序列中，有一种是反向重复序列，也叫回文结构；长度不等，从几个核苷酸到几百个核苷酸等。;这种反向重复序列在基因组中很多，据推测可能与基因的复制、转录等调控有关。;回文结构的意义：

1）是限制性内切酶的识别位点。

2）具有调节基因的表达作用,如色氨酸操纵子的前的弱化子。

3）转录终止时的识别结构。

4）有利于稳定RNA的结构和行使功能。

5）基因工程中DNA序列的方便操作。;三.?轻度重复顺序和中度重复顺序;第13页，共38页。;第14页，共38页。;第15页，共38页。;第16页，共38页。;四Alu家族;在人基因组中Alu基因家族是一个中等重复序列，长度在300bp左右，单倍体基因组中有30万份，分散在各染色体上。;Alu家族的每一个成员都很相似，由130bp的串联重复组成，常见的是二聚体形式，在右半部分的中部有一个31bp的无关序列插在中间。这个插入序列（IS）来自7SL（是信号识别蛋白SRP的一个成分）。;Alu家族的广泛存在说明其可能具有某种功能，但是目前还不十分了解。;在小鼠体中有一种和Alu序列同源的序列叫做B1家族，约有5万个成员。重复单位为130bp，相当于Alu序列的一个单体，和Alu序列的同源性为70%-80%。;KpnⅠ家族是中度重复顺序中仅次于Alu家族的第二大家族。用限制性内切酶KpnⅠ消化人类及其它灵长类动物的DNA，在电泳谱上可以看到4个不同长度的片段，分别为1.2,1.5,1.8和1.9kb，这就是所谓的KpnⅠ家族。KpnⅠ家族成员顺序比Alu家族更长（如人KpnⅠ顺序长6.4kb），而且更加不均一，呈散在分布，属于中度重复顺序的长分散序列。KpnⅠ家族的拷贝数约为3000－4800个，占人体基因组的1％。;Hinf家族：这一家族以319bp长度的串联重复存在于人体基因组中。用限制性内切酶HinfⅠ消化人体DNA，可以分离到这一片段。Hinf家族在单位基因组内约有50－100个拷贝，分散在不同的区域。319bp单位可以再分成两个亚单位，分别为172bp和147bp,它们之间有70%的同源性。;五.高度重复顺序;高度重复是一种简单的重复序列，有的重复单位不???过6bp，但是重复的次数可以达到几十万次之多，故称为高度重复序列，也叫做卫星DNA。;卫星DNA：是高等真核生物基因组重复程度最高的成分，由非常短的串联多次重复DNA序列组成，一般占基因组的10%-30%。因为其序列复杂性不高，所以有时称为简单序列DNA；卫星DNA以大的基因簇分布（100-3000kb），常位于异染色质的着丝粒，可能在染色体的功能中起作用。;有一些比较复杂的卫星DNA据推测可能是从简单的短序列重复发展变化而来的。;一般这些序列中的GC含量与其他的主体DNA不同（例如小鼠中为30%，低于其主体DNA的42%GC含量）。所以在进行氯化铯密度梯度超离心时，这些DNA由于密度小，会与主体的DNA带分开而出现在上面，所以称为卫星DNA。;也有的卫星DNA密度比主体DNA密度大，出现在主体DNA的下面。

隐秘的卫星DNA是指与主体DNA的密度类似，使用氯化铯密度梯度超离心不能分开的高度重复序列，但是可以通过其他的方法将其分离出来。;人们开始时认为这些高度重复的DNA序列没有什么功能。近来发现与DNA复制、基因表达的调节、基因的转位、减数分裂时染色体的配对等过程有重要关系。;等位小卫星DNA是指小卫星中含有的重复序列数目相同；反之，不等位小卫星DNA是指小卫星中含有的重复序列数目不同。;卫星DNA：基本单位长度171bp

小卫星DNA：基本单位长度15-65bp

微卫星DNA：基本单位长度2-8bp;人类VNTRs的第一个探针;第34页，共38页。;L1家族;第36页，共38页。;第37页，共38页。;谢谢大家！