油松SAUR基因家族鉴定及其干旱胁迫表达模式分析.pdfVIP

第

46

卷

第

8

期北

京

林

业

大

学

学

报Vol.

46，No.

8

2024

年

8

月JOURNAL

OF

BEIJING

FORESTRY

UNIVERSITYAug.，2024

DOI:10.12171/j.1000−1522

油松SAUR基因家族鉴定及其干旱胁迫表达模式分析

燕佳惠

周成城

钮世辉

李

伟

（林木遗传育种全国重点实验室，北京林业大学生物科学与技术学院，林木育种与生态修复国家工程研究中心，北京

100083）

摘要:【目的】本研究旨在鉴定油松生长素响应基因SAUR家族，分析其基本特征及其在干旱胁迫中的作用，以期为油松及

其他针叶树

SAUR基因家族功能解析提供参考。【方法】以油松全基因组数据信息为基础，blast比对鉴定出SAUR基因家

族，通过生物信息学方法分析其基因结构、氨基酸特性、染色体定位、基因进化、基因功能，并通过RNA-Seq数据分析其

在干旱胁迫下的表达模式。【结果】（1）在油松中共鉴定出66个SAUR家族基因，命名为PtSAUR1

~

PtSAUR66，其中

60个SAUR家族成员不均匀地分布在9

条染色体上，多呈现簇状分布。（2）蛋白理化特征分析结果表明，76%的

SAUR蛋白呈碱性；亚细胞预测结果显示，74%的SAUR蛋白可定位到细胞核中。（3）油松与银杏和巨杉SAUR基因的

共线关系结果显示：与银杏相比，油松与巨杉的同源关系更近。（4）顺式作用元件预测结果显示：SAUR

家族基因的启动

子中预测到多种激素（茉莉酸甲酯、脱落酸、生长素等）、非生物胁迫（低温、干旱等）相关的顺式作用元件，其中茉莉酸甲

酯相关的元件数最多，生长素相关的元件数最少。（5）系统进化分析显示：油松SAUR家族蛋白可分为7个类群，油松中

既存在相近于被子植物的SAUR蛋白，也存在前期分离出来的油松独有的SAUR蛋白。（6）RNA-Seq数据分析结果显

示：油松SAUR基因家族对于干旱胁迫具有一定的调节作用，其中PtSAUR23、PtSAUR59和PtSAUR66

3个基因成员变化

显著，推测为抗旱的关键基因。【结论】油松SAUR家族基因可参与调控干旱胁迫，PtSAUR23、PtSAUR59和PtSAUR66可

能在这个过程中起到关键的作用。

关键词：油松；SAUR基因家族；干旱胁迫；基因表达

中图分类号：S791.254

文献标志码：A

文章编号：1000−1522(2024)08−0057−11

引文格式：燕佳惠，周成城，钮世辉，等.

油松SAUR基因家族鉴定及其干旱胁迫表达模式分析[J].

北京林业大学学报，

2024，46(8)：57−67.

Yan

Jiahui,

Zhou

Chengcheng,

Niu

Shihui,

et

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Identification

of

SAUR

gene

family

in

Pinustabuliformis

and

analysis

on

its

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patterns

under

drought

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Journal

of

Beijing

Forestry

University,

2024,

46(8):

57−67.

IdentificationofSAURgenefamilyinPinustabuliformisandanalysisonits

expressionpatternsunderdroughtstress

Yan

JiahuiZhou

Chengchen