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生物技术通报
·研究报告·BIOTECHNOLOGYBULLETIN2025,41(4):145-155
马铃薯GRAM基因家族鉴定与表达分析
111111,21,2
刘涛王志淇吴文博石文婷王超楠杜崇杨中敏
(1.新疆农业大学园艺学院,乌鲁木齐830052;2.新疆农业大学园艺学博士后流动站,乌鲁木齐830052)
摘要:【目的】GRAM(Glucosyltransferases,Rab-likeGTPaseactivatorsandMyotubularins)是普遍存在于动、植物蛋白中的
结构域,在植物生长发育及响应逆境胁迫等过程中发挥着重要功能。在马铃薯全基因组中鉴定GRAM基因家族成员,分析马铃薯
GRAM家族基因在盐胁迫下的表达模式,探究GRAM家族在马铃薯盐胁迫过程中的作用。【方法】采用生物信息学方法鉴定马铃薯
中GRAM家族成员,并对蛋白理化性质、染色体定位、亚细胞定位、基因结构、motif及共线性等方面进行分析。利用转录组测序
和荧光定量PCR(RT-qPCR)对该家族成员在盐胁迫下的表达模式进行研究。【结果】在马铃薯中共鉴定到26个GRAM家族基因,
不均匀地分布于7条染色体上;理化性质分析显示StGRAM全部为亲水性蛋白,大部分为碱性蛋白;亚细胞定位预测StGRAM蛋白
大部分存在于叶绿体和细胞核;根据系统进化分析可将StGRAM家族分为3个亚族,同一亚族成员具有相似的基因结构及motif分
布;通过马铃薯物种内共线性分析发现StGRAM仅有一对同源基因,物种间共线性显示StGRAM在水稻和拟南芥中分别存在5对和
3对同源基因;在StGRAM基因启动子区发现大量的激素响应元件和逆境胁迫响应元件;转录组测序分析和RT-qPCR分析显示,
StGRAM基因受盐胁迫的诱导表达,可能参与了马铃薯对盐胁迫的响应过程,StGRAM25基因可能对中性盐和碱性盐有不同的响应
模式。【结论】StGRAM基因家族在马铃薯盐胁迫响应和信号转导过程中发挥着重要作用。
关键词:马铃薯;GRAM基因家族;生物信息学;盐胁迫;表达分析
DOI:10.13560/ki.biotech.bull.1985.2024-0804
IdentificationandExpressionAnalysisoftheGRAMGeneFamilyin
Potato
111111,21,2
LIUTaoWANGZhi-qiWUWen-boSHIWen-tingWANGChao-nanDUChongYANGZhong-min
(1.XinjiangAgriculturalUniversity,CollegeofHorticulture,Urumuqi830052;2.XinjiangAgriculturalUniversity,PostdoctoralStationofHorti⁃
culture,Urumuqi830052)
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