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分子植物育种，2025年，第23卷，第1期，第34-41页

MolecularPlantBrol.23,No.1,34-41

研究报告

ResearchReport

番茄NIN基因家族全基因组鉴定及表达分析

张嘉宁王延峰任敏孙会茹

延安大学生命科学学院，陕西省红枣重点实验室，延安，716000

*通信作者，shrpiaoliu@163.com

摘要NIN(Noduleinception)是一类植物中特有的且具有高度保守的RWP-RK结构域的转录因子家族，

在植物氮元素信号传导和配子体发育过程中起关键的调控作用。近年来关于NIN基因家族的研究颇多，但

番茄中对NIN转录因子的系统研究还未见报道。本研究利用生物信息学方法在番茄中鉴定出11个NIN基

因，并进行了系统发育树、染色体定位、保守结构域、启动子顺式作用元件和组织表达等分析。结果表明：番茄

的NIN家族可分为4个亚家族(I~IV)，且不均匀地分布在7条染色体上。保守结构域分析发现SININ蛋白

序列均具有RWP-RK保守结构域，部分成员还包括PB1结构域。启动子顺式作用元件分析发现绝大部分

SININ基因启动子含有激素(特别是脱落酸和生长素)响应元件。基于不同组织的转录组数据分析发现：SININ

基因在不同组织发育过程中表达量有所差异，其中同属第I亚家族的SININI、SININ5、SININ6、SININ7和

SININ9在根中优势表达，表明这些基因可能参与番茄根的发育或氮元素传递过程。本研究通过对番茄NIN

家族系统的分析，可为进一步研究SININ基因的生物学功能提供理论基础。

关键词番茄(Solanumlycopersicum);NIN转录因子；生物信息学；表达分析

Genome-wideIdentificationandExpressionAnalysisofNINGeneFamily

inSolanumlycopersicum

ZhangJianingWangYanfengRenMinSunHuiru*

ShaanxiKeyLaboratoryofChineseJujube,CollegeofLifeSciences,YananUniversity,Yanan,716000

*Corresjonrpiaoliu@163.com

DOI:10.13271/j.mpb.023.000034

AbstractNIN(Noduleinception)transcriptionfactorisauniquefamilywiththehighlyconservedRWP-RKdo-

main,whichplaysacoreregulatoryroleinnitrogensignaltransductionandgametophytedevelopmentinplant.In

recently,therehavebeenmanystudiesonNINgenefamily,butnocomprehensiveanalysisofthegenefamilyin

tomatohasbeenreported.Inthisstudy,11NINgeneswereidentifiedintomato(Solanumlycopersicum)andtheanaly-

sesofphylogenetictree,chromosomallocalization,conserveddomains,promotercis-actingelementsandtissue

expressionwereperformedbybioinformaticsmethods.TheresultsshowedthatSININsweredividedinto4sub-

families(I~IV),andunevenlydistributedon7chromosomes.AllofSININscontainedtheconservedRWP-RK

domain,andsomeSININsalsoincludedPB1domainbyconservativedomainanalysis.Promotercis-actingele-

mentanalysisrevea