白菜型油菜CCT基因的全基因组鉴定及表达模式分析.pdfVIP

第

41

卷第

11

期草业科学2637-2650

Vol.41,

No.11PRATACULTURAL

SCIENCE11/2024

DOI:

10.11829/j.issn.1001-0629.2024-0242

李华欣，王龙，马茜茹，裴大妹，肖麓.

白菜型油菜CCT基因的全基因组鉴定及表达模式分析.

草业科学,

2024,

41(11):

2637-2650.

LI

H

X,

WANG

L,

MA

Q

R,

PEI

D

M,

XIAO

L.

Genome-wide

identification

and

expression

pattern

analysis

of

CCT

genes

in

Brassica

rapa.

Pratacultural

Science,

2024,

41(11):

2637-2650.

白菜型油菜CCT基因的全基因组

鉴定及表达模式分析

李华欣，王

龙，马茜茹，裴大妹，肖

麓

（青海大学农林科学院,

青海

西宁

810016）

摘要：CCT基因是指编码蛋白包含CCT

(CONSTANS,

CONSTANS-LIKE

和

TOC1)结构域的基因的统称，广泛存在于

高等植物中，并且是与植物开花性状相关的重要基因家族之一，这些基因不仅参与了植物对光周期的响应过程，还

在非生物胁迫应答以及植物激素信号转导等环节中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学和比较基因组学的方

法，最终在白菜型油菜(Brassicachinensis

var.

oleiferaMakinoetNemoto)中鉴定到69个CCT家族基因，并对其理化性

质、系统进化关系、保守结构域、基因结构、共线性关系、顺式作用元件、KEGG富集和不同组织/器官中的表达模

式等进行了分析。结果表明，69个BrCCTs基因不均匀地分布在10条染色体上，根据保守结构域的不同，可以分为

4个亚族，同一亚族成员的保守基序高度相似，然而基因结构差异较大，并且多数成员均含有光响应元件和激素响

应元件，表明其可能在调节植物开花以及生长发育过程中发挥重要作用。KEGG富集分析发现CCT家族基因主要富

集在细胞功能和核酸结合位点通路上。转录组结果表明，69个BrCCTs在根、茎、叶、花和愈伤组织中有着不同的

表达模式，尤其COL亚族的成员表达水平较为显著。本研究为进一步了解白菜型油菜CCT基因家族的功能和作用提

供了参考，为油菜早熟品种的选育和改良奠定了基础。

关键词：白菜型油菜；CCT基因；开花时间；进化分析；生物信息学；转录组

文献标识码：A

文章编号：1001-0629(2024)11-2637-14

Genome-wideidentificationandexpressionpatternanalysisof

CCTgenesinBrassicarapa

LI

Huaxin,

WANG

Long,

MA

Qianru,

PEI

Damei,

XIAO

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(Academy

of

Agri